doc: add Sphinx framework for building docs
authorW. Trevor King <wking@tremily.us>
Mon, 19 Nov 2012 08:47:45 +0000 (03:47 -0500)
committerW. Trevor King <wking@tremily.us>
Mon, 19 Nov 2012 08:52:48 +0000 (03:52 -0500)
I can't get numpydoc working.  Enabling the module raises lots of
warnings:

  $ PYTHONPATH=.. make SPHINXBUILD=sphinx-build-2.7 dirhtml
  ...
  Traceback (most recent call last):tools
    File "/usr/lib/python2.7/site-packages/sphinx/ext/autodoc.py", line 321, in import_object
      __import__(self.modname)
  ImportError: No module named TestRFFT
  Traceback (most recent call last):
    File "/usr/lib/python2.7/site-packages/sphinx/ext/autodoc.py", line 321, in import_object
      __import__(self.modname)
  ImportError: No module named TestUnitaryRFFT

  /.../FFT-tools/doc/source/mod/FFT_tools.rst:64: WARNING: autodoc can't import/find exception 'FFT_tools.TestRFFT.failureException', it reported error: "No module named TestRFFT", please check your spelling and sys.path
  /.../FFT-tools/doc/source/mod/FFT_tools.rst:64: WARNING: failed to import object FFT_tools.TestRFFT.failureException
  /.../FFT-tools/doc/source/mod/FFT_tools.rst:64: WARNING: toctree references unknown document u'mod/FFT_tools.TestRFFT.addCleanup'
  ...
  None:None: WARNING: toctree contains reference to nonexisting document 'mod/FFT_tools.TestRFFT.addCleanup'
  ...
  <autosummary>:None: WARNING: toctree contains reference to nonexisting document 'mod/FFT_tools.TestRFFT.addCleanup'
  ...

.gitignore
doc/Makefile [new file with mode: 0644]
doc/source/.gitignore [new file with mode: 0644]
doc/source/_static/.gitignore [new file with mode: 0644]
doc/source/_templates/.gitignore [new file with mode: 0644]
doc/source/conf.py [new file with mode: 0755]
doc/source/index.rst [new file with mode: 0644]

index a90dda71ba74b619ca60c0390913c1da2843227e..37dca5627b892fbc8bf941e31cbc7caf72f6c333 100644 (file)
@@ -1,3 +1,4 @@
 *.pyc
 MANIFEST
+build
 dist
diff --git a/doc/Makefile b/doc/Makefile
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e826900
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,153 @@
+# Makefile for Sphinx documentation
+#
+
+# You can set these variables from the command line.
+SPHINXOPTS    =
+SPHINXBUILD   = sphinx-build
+PAPER         =
+BUILDDIR      = build
+
+# Internal variables.
+PAPEROPT_a4     = -D latex_paper_size=a4
+PAPEROPT_letter = -D latex_paper_size=letter
+ALLSPHINXOPTS   = -d $(BUILDDIR)/doctrees $(PAPEROPT_$(PAPER)) $(SPHINXOPTS) source
+# the i18n builder cannot share the environment and doctrees with the others
+I18NSPHINXOPTS  = $(PAPEROPT_$(PAPER)) $(SPHINXOPTS) source
+
+.PHONY: help clean html dirhtml singlehtml pickle json htmlhelp qthelp devhelp epub latex latexpdf text man changes linkcheck doctest gettext
+
+help:
+       @echo "Please use \`make <target>' where <target> is one of"
+       @echo "  html       to make standalone HTML files"
+       @echo "  dirhtml    to make HTML files named index.html in directories"
+       @echo "  singlehtml to make a single large HTML file"
+       @echo "  pickle     to make pickle files"
+       @echo "  json       to make JSON files"
+       @echo "  htmlhelp   to make HTML files and a HTML help project"
+       @echo "  qthelp     to make HTML files and a qthelp project"
+       @echo "  devhelp    to make HTML files and a Devhelp project"
+       @echo "  epub       to make an epub"
+       @echo "  latex      to make LaTeX files, you can set PAPER=a4 or PAPER=letter"
+       @echo "  latexpdf   to make LaTeX files and run them through pdflatex"
+       @echo "  text       to make text files"
+       @echo "  man        to make manual pages"
+       @echo "  texinfo    to make Texinfo files"
+       @echo "  info       to make Texinfo files and run them through makeinfo"
+       @echo "  gettext    to make PO message catalogs"
+       @echo "  changes    to make an overview of all changed/added/deprecated items"
+       @echo "  linkcheck  to check all external links for integrity"
+       @echo "  doctest    to run all doctests embedded in the documentation (if enabled)"
+
+clean:
+       -rm -rf $(BUILDDIR)/*
+
+html:
+       $(SPHINXBUILD) -b html $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/html
+       @echo
+       @echo "Build finished. The HTML pages are in $(BUILDDIR)/html."
+
+dirhtml:
+       $(SPHINXBUILD) -b dirhtml $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/dirhtml
+       @echo
+       @echo "Build finished. The HTML pages are in $(BUILDDIR)/dirhtml."
+
+singlehtml:
+       $(SPHINXBUILD) -b singlehtml $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/singlehtml
+       @echo
+       @echo "Build finished. The HTML page is in $(BUILDDIR)/singlehtml."
+
+pickle:
+       $(SPHINXBUILD) -b pickle $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/pickle
+       @echo
+       @echo "Build finished; now you can process the pickle files."
+
+json:
+       $(SPHINXBUILD) -b json $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/json
+       @echo
+       @echo "Build finished; now you can process the JSON files."
+
+htmlhelp:
+       $(SPHINXBUILD) -b htmlhelp $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/htmlhelp
+       @echo
+       @echo "Build finished; now you can run HTML Help Workshop with the" \
+             ".hhp project file in $(BUILDDIR)/htmlhelp."
+
+qthelp:
+       $(SPHINXBUILD) -b qthelp $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/qthelp
+       @echo
+       @echo "Build finished; now you can run "qcollectiongenerator" with the" \
+             ".qhcp project file in $(BUILDDIR)/qthelp, like this:"
+       @echo "# qcollectiongenerator $(BUILDDIR)/qthelp/FFT-tools.qhcp"
+       @echo "To view the help file:"
+       @echo "# assistant -collectionFile $(BUILDDIR)/qthelp/FFT-tools.qhc"
+
+devhelp:
+       $(SPHINXBUILD) -b devhelp $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/devhelp
+       @echo
+       @echo "Build finished."
+       @echo "To view the help file:"
+       @echo "# mkdir -p $$HOME/.local/share/devhelp/FFT-tools"
+       @echo "# ln -s $(BUILDDIR)/devhelp $$HOME/.local/share/devhelp/FFT-tools"
+       @echo "# devhelp"
+
+epub:
+       $(SPHINXBUILD) -b epub $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/epub
+       @echo
+       @echo "Build finished. The epub file is in $(BUILDDIR)/epub."
+
+latex:
+       $(SPHINXBUILD) -b latex $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/latex
+       @echo
+       @echo "Build finished; the LaTeX files are in $(BUILDDIR)/latex."
+       @echo "Run \`make' in that directory to run these through (pdf)latex" \
+             "(use \`make latexpdf' here to do that automatically)."
+
+latexpdf:
+       $(SPHINXBUILD) -b latex $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/latex
+       @echo "Running LaTeX files through pdflatex..."
+       $(MAKE) -C $(BUILDDIR)/latex all-pdf
+       @echo "pdflatex finished; the PDF files are in $(BUILDDIR)/latex."
+
+text:
+       $(SPHINXBUILD) -b text $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/text
+       @echo
+       @echo "Build finished. The text files are in $(BUILDDIR)/text."
+
+man:
+       $(SPHINXBUILD) -b man $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/man
+       @echo
+       @echo "Build finished. The manual pages are in $(BUILDDIR)/man."
+
+texinfo:
+       $(SPHINXBUILD) -b texinfo $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/texinfo
+       @echo
+       @echo "Build finished. The Texinfo files are in $(BUILDDIR)/texinfo."
+       @echo "Run \`make' in that directory to run these through makeinfo" \
+             "(use \`make info' here to do that automatically)."
+
+info:
+       $(SPHINXBUILD) -b texinfo $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/texinfo
+       @echo "Running Texinfo files through makeinfo..."
+       make -C $(BUILDDIR)/texinfo info
+       @echo "makeinfo finished; the Info files are in $(BUILDDIR)/texinfo."
+
+gettext:
+       $(SPHINXBUILD) -b gettext $(I18NSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/locale
+       @echo
+       @echo "Build finished. The message catalogs are in $(BUILDDIR)/locale."
+
+changes:
+       $(SPHINXBUILD) -b changes $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/changes
+       @echo
+       @echo "The overview file is in $(BUILDDIR)/changes."
+
+linkcheck:
+       $(SPHINXBUILD) -b linkcheck $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/linkcheck
+       @echo
+       @echo "Link check complete; look for any errors in the above output " \
+             "or in $(BUILDDIR)/linkcheck/output.txt."
+
+doctest:
+       $(SPHINXBUILD) -b doctest $(ALLSPHINXOPTS) $(BUILDDIR)/doctest
+       @echo "Testing of doctests in the sources finished, look at the " \
+             "results in $(BUILDDIR)/doctest/output.txt."
diff --git a/doc/source/.gitignore b/doc/source/.gitignore
new file mode 100644 (file)
index 0000000..2680cfd
--- /dev/null
@@ -0,0 +1 @@
+mod
diff --git a/doc/source/_static/.gitignore b/doc/source/_static/.gitignore
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e69de29
diff --git a/doc/source/_templates/.gitignore b/doc/source/_templates/.gitignore
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e69de29
diff --git a/doc/source/conf.py b/doc/source/conf.py
new file mode 100755 (executable)
index 0000000..5237fcc
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,274 @@
+#!/usr/bin/env python3
+# -*- coding: utf-8 -*-
+#
+# FFT-tools documentation build configuration file, created by
+# sphinx-quickstart on Mon Nov 19 01:53:51 2012.
+#
+# This file is execfile()d with the current directory set to its containing dir.
+#
+# Note that not all possible configuration values are present in this
+# autogenerated file.
+#
+# All configuration values have a default; values that are commented out
+# serve to show the default.
+
+import os
+import sys
+
+# If extensions (or modules to document with autodoc) are in another directory,
+# add these directories to sys.path here. If the directory is relative to the
+# documentation root, use os.path.abspath to make it absolute, like shown here.
+#sys.path.insert(0, os.path.abspath('.'))
+
+# -- General configuration -----------------------------------------------------
+
+# If your documentation needs a minimal Sphinx version, state it here.
+#needs_sphinx = '1.0'
+
+# Add any Sphinx extension module names here, as strings. They can be extensions
+# coming with Sphinx (named 'sphinx.ext.*') or your custom ones.
+extensions = [
+    'sphinx.ext.autodoc',
+    'sphinx.ext.autosummary',
+    'sphinx.ext.doctest',
+    'sphinx.ext.intersphinx',
+    'sphinx.ext.pngmath',
+    #'numpydoc',
+    ]
+
+autosummary_generate = True
+autodoc_default_flags = ['members']
+
+# Add any paths that contain templates here, relative to this directory.
+templates_path = ['_templates']
+
+# The suffix of source filenames.
+source_suffix = '.rst'
+
+# The encoding of source files.
+#source_encoding = 'utf-8-sig'
+
+# The master toctree document.
+master_doc = 'index'
+
+# General information about the project.
+project = 'FFT-tools'
+author = 'W. Trevor King'
+copyright = '2008-2012, {}'.format(author)
+
+# The version info for the project you're documenting, acts as replacement for
+# |version| and |release|, also used in various other places throughout the
+# built documents.
+#
+# The short X.Y version.
+version = '0.4'
+# The full version, including alpha/beta/rc tags.
+release = version
+
+# The language for content autogenerated by Sphinx. Refer to documentation
+# for a list of supported languages.
+#language = None
+
+# There are two options for replacing |today|: either, you set today to some
+# non-false value, then it is used:
+#today = ''
+# Else, today_fmt is used as the format for a strftime call.
+#today_fmt = '%B %d, %Y'
+
+# List of patterns, relative to source directory, that match files and
+# directories to ignore when looking for source files.
+exclude_patterns = []
+
+# The reST default role (used for this markup: `text`) to use for all documents.
+#default_role = None
+
+# If true, '()' will be appended to :func: etc. cross-reference text.
+#add_function_parentheses = True
+
+# If true, the current module name will be prepended to all description
+# unit titles (such as .. function::).
+#add_module_names = True
+
+# If true, sectionauthor and moduleauthor directives will be shown in the
+# output. They are ignored by default.
+#show_authors = False
+
+# The name of the Pygments (syntax highlighting) style to use.
+pygments_style = 'sphinx'
+
+# A list of ignored prefixes for module index sorting.
+#modindex_common_prefix = []
+
+
+# -- Options for HTML output ---------------------------------------------------
+
+# The theme to use for HTML and HTML Help pages.  See the documentation for
+# a list of builtin themes.
+html_theme = 'default'
+
+# Theme options are theme-specific and customize the look and feel of a theme
+# further.  For a list of options available for each theme, see the
+# documentation.
+#html_theme_options = {}
+
+# Add any paths that contain custom themes here, relative to this directory.
+#html_theme_path = []
+
+# The name for this set of Sphinx documents.  If None, it defaults to
+# "<project> v<release> documentation".
+#html_title = None
+
+# A shorter title for the navigation bar.  Default is the same as html_title.
+#html_short_title = None
+
+# The name of an image file (relative to this directory) to place at the top
+# of the sidebar.
+#html_logo = None
+
+# The name of an image file (within the static path) to use as favicon of the
+# docs.  This file should be a Windows icon file (.ico) being 16x16 or 32x32
+# pixels large.
+#html_favicon = None
+
+# Add any paths that contain custom static files (such as style sheets) here,
+# relative to this directory. They are copied after the builtin static files,
+# so a file named "default.css" will overwrite the builtin "default.css".
+html_static_path = ['_static']
+
+# If not '', a 'Last updated on:' timestamp is inserted at every page bottom,
+# using the given strftime format.
+#html_last_updated_fmt = '%b %d, %Y'
+
+# If true, SmartyPants will be used to convert quotes and dashes to
+# typographically correct entities.
+#html_use_smartypants = True
+
+# Custom sidebar templates, maps document names to template names.
+#html_sidebars = {}
+
+# Additional templates that should be rendered to pages, maps page names to
+# template names.
+#html_additional_pages = {}
+
+# If false, no module index is generated.
+#html_domain_indices = True
+
+# If false, no index is generated.
+#html_use_index = True
+
+# If true, the index is split into individual pages for each letter.
+#html_split_index = False
+
+# If true, links to the reST sources are added to the pages.
+#html_show_sourcelink = True
+
+# If true, "Created using Sphinx" is shown in the HTML footer. Default is True.
+#html_show_sphinx = True
+
+# If true, "(C) Copyright ..." is shown in the HTML footer. Default is True.
+#html_show_copyright = True
+
+# If true, an OpenSearch description file will be output, and all pages will
+# contain a <link> tag referring to it.  The value of this option must be the
+# base URL from which the finished HTML is served.
+#html_use_opensearch = ''
+
+# This is the file name suffix for HTML files (e.g. ".xhtml").
+#html_file_suffix = None
+
+# Output file base name for HTML help builder.
+htmlhelp_basename = 'FFT-toolsdoc'
+
+
+# -- Options for LaTeX output --------------------------------------------------
+
+latex_preamble = r"""
+\newcommand{\gaussian}{\textrm{gaussian}}
+\newcommand{\rect}{\textrm{rect}}
+\newcommand{\rfft}{\textrm{rfft}}
+\newcommand{\sinc}{\textrm{sinc}}
+"""
+
+latex_elements = {
+# The paper size ('letterpaper' or 'a4paper').
+#'papersize': 'letterpaper',
+
+# The font size ('10pt', '11pt' or '12pt').
+#'pointsize': '10pt',
+
+# Additional stuff for the LaTeX preamble.
+'preamble': latex_preamble,
+}
+
+# Grouping the document tree into LaTeX files. List of tuples
+# (source start file, target name, title, author, documentclass [howto/manual]).
+latex_documents = [
+  ('index', '{}.tex'.format(project), '{} Documentation'.format(project),
+   author, 'manual'),
+]
+
+# The name of an image file (relative to this directory) to place at the top of
+# the title page.
+#latex_logo = None
+
+# For "manual" documents, if this is true, then toplevel headings are parts,
+# not chapters.
+#latex_use_parts = False
+
+# If true, show page references after internal links.
+#latex_show_pagerefs = False
+
+# If true, show URL addresses after external links.
+#latex_show_urls = False
+
+# Documents to append as an appendix to all manuals.
+#latex_appendices = []
+
+# If false, no module index is generated.
+#latex_domain_indices = True
+
+
+# -- Options for manual page output --------------------------------------------
+
+# One entry per manual page. List of tuples
+# (source start file, name, description, authors, manual section).
+man_pages = [
+    ('index', project.lower(), '{} Documentation'.format(project),
+     [author], 1)
+]
+
+# If true, show URL addresses after external links.
+#man_show_urls = False
+
+
+# -- Options for Texinfo output ------------------------------------------------
+
+# Grouping the document tree into Texinfo files. List of tuples
+# (source start file, target name, title, author,
+#  dir menu entry, description, category)
+texinfo_documents = [
+  ('index', project, '{} Documentation'.format(project),
+   author, project, "Wrap Numpy's fft module to reduce clutter.",
+   'Miscellaneous'),
+]
+
+# Documents to append as an appendix to all manuals.
+#texinfo_appendices = []
+
+# If false, no module index is generated.
+#texinfo_domain_indices = True
+
+# How to display URL addresses: 'footnote', 'no', or 'inline'.
+#texinfo_show_urls = 'footnote'
+
+
+# Example configuration for intersphinx: refer to the Python standard library.
+intersphinx_mapping = {
+    'python': ('http://docs.python.org/', None),
+    'numpy':('http://docs.scipy.org/doc/numpy',None),
+    }
+
+
+# -- Options for pngmath ------------------------------------------------------
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+pngmath_latex_preamble = latex_preamble
diff --git a/doc/source/index.rst b/doc/source/index.rst
new file mode 100644 (file)
index 0000000..53fe67a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,17 @@
+Welcome to FFT-tools's documentation!
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+Module documentation:
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+.. autosummary::
+   :toctree: mod
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+   FFT_tools
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+Indices and tables
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+* :ref:`genindex`
+* :ref:`modindex`
+* :ref:`search`