src/hooke/main.tex

   1 \chapter{Data analysis with \Hooke}
   2 \label{sec:hooke}
   3
   4 Individual unfolding force curves acquired with the \pyafm\ stack
   5 (\cref{sec:pyafm}) are hard to compare with other experimental data.
   6 One way to analyze them in bulk is to extract unfolding force
   7 histograms.  These experimental histograms can then be used for
   8 fitting simulated models with \sawsim\ (\cref{sec:sawsim}), and the
   9 model fitting parameters will summarize the kinetic behavior.  In this
  10 chapter, I'll discuss the histogram extraction procedure and the
  11 \Hooke\ package that facilitates it.
  12
  13 \input{hooke/history}
  14 \input{hooke/drivers}
  15 \input{hooke/plugins}
  16 \input{hooke/ui}
  17 \input{hooke/discussion}
  18 \input{hooke/conclusions}