licenses/tm-align

   1 TMalign.f:
   2
   3 This program is to identify the best alignment of two protein
   4 structures that gives the highest TM-score. Input structures must
   5 be in the PDB format. By default, TM-score is normalized by the
   6 second protein. Users can obtain a brief instruction by simply
   7 running the program without arguments. For comments/suggestions,
   8 please contact email: zhng@umich.edu.
   9
  10 Reference to cite:
  11 Yang Zhang, Jeffrey Skolnick, Nucl. Acid Res. 2005 33: 2303-9
  12
  13 Permission to use, copy, modify, and distribute this program for
  14 any purpose, with or without fee, is hereby granted, provided that
  15 the notices on the head, the reference information, and this
  16 copyright notice appear in all copies or substantial portions of
  17 the Software. It is provided "as is" without express or implied
  18 warranty.
  19
  20 ---
  21
  22 TMscore.f:
  23
  24 This program is to compare two protein structures and identify the
  25 best superposition that has the highest TM-score. Input structures
  26 must be in the PDB format. By default, TM-score is normalized by
  27 the second protein. Users can obtain a brief instruction by simply
  28 running the program without arguments. For comments/suggestions,
  29 please contact email: zhng@umich.edu.
  30
  31 Reference:
  32 Yang Zhang, Jeffrey Skolnick, Proteins, 2004 57:702-10.
  33
  34 Permission to use, copy, modify, and distribute this program for
  35 any purpose, with or without fee, is hereby granted, provided that
  36 the notices on the head, the reference information, and this
  37 copyright notice appear in all copies or substantial portions of
  38 the Software. It is provided "as is" without express or implied
  39 warranty.