licenses/psipred

   1 PLEASE READ THE FOLLOWING LICENSE AGREEMENT. BY USING THE PROGRAM YOU ARE
   2 ACKNOWLEDGING THE FACT THAT YOU AGREE TO THE TERMS OUTLINED IN THIS
   3 AGREEMENT. USERS WISHING TO USE THE SOFTWARE FOR COMMERCIAL ACTIVITIES
   4 NOT COVERED BY THIS AGREEMENT SHOULD SEND E-MAIL TO: dtj@cs.ucl.ac.uk
   5
   6 * NOTE RECENT CHANGES TO PARAGRAPH 8 *
   7
   8
   9
  10  PSIPRED2 - PROTEIN SECONDARY STRUCTURE PREDICTION PROGRAM BY D.T.JONES
  11  ----------------------------------------------------------------------
  12
  13                           GENERAL LICENSE &
  14                           -----------------
  15
  16                      CONFIDENTIALITY AGREEMENT
  17                      -------------------------
  18
  19
  20
  21 In regard to the protein structure prediction program (PSIPRED2)
  22 herewith (the Software) the copyright and other intellectual property
  23 rights to which belong to the Author(s).
  24
  25 Any user (the User) of the program undertakes to the Copyright holder that he
  26 or she shall be bound by the following terms and conditions:-
  27
  28 1. The User will receive the Software and any related documentation in
  29 confidence and will not use the same except for the purpose of their own
  30 research. The Software will be used only by such of the User's officers or
  31 employees to whom it must reasonably be communicated to enable them to
  32 undertake their research and who agree to be bound by the same confidence.
  33 The User shall procure and enforce such agreement from his or her staff for
  34 the benefit of the Copyright holder.
  35
  36 2. The publication of research using the Software must include an
  37 appropriate citation to the method:
  38
  39 Jones, D.T. (1999) Protein secondary structure prediction based on
  40 position-specific scoring matrices. J. Mol. Biol. 292:195-202.
  41
  42 3. All forms of the Software will be kept in a reasonably secure place to
  43 prevent unauthorised access.
  44
  45 4. Each copy of the Software or, if not practicable then, any package
  46 associated therewith shall be suitably marked (and such marking maintained)
  47 with the following copyright notice: "Copyright 2000 D.T.Jones. All Rights
  48 Reserved.".
  49
  50 5. The Software may be modified, but any changes made shall be communicated
  51 to the Author(s) and made freely available.
  52
  53 6. The Software may not be sold as a standalone package, or incorporated into
  54 a commercial software package without the written permission of the Copyright
  55 holder. The Software may be used freely for individual academic or commercial
  56 research. The Software may also be made freely available for training or
  57 teaching purposes.
  58
  59 7. The results produced by the Software may not be incorporated into any
  60 data banks or databases which are subject to the payment of access or
  61 license fees without the written permission of the Copyright holder.
  62
  63 8. The Software may be made available to users over a local network or
  64 wide area network (including the Internet), but only if access is granted
  65 free of charge to all authorised users. Incorporation of the Software into
  66 a commercial Web site or other fee paying service is not allowed without
  67 the written permission of the Copyright holder. If PSIPRED results are
  68 returned to the user via such a network service, then a suitable
  69 acknowledgement of the PSIPRED method must be returned somewhere in the
  70 output text.
  71
  72 9. The confidentiality obligation in paragraph one shall not apply:
  73
  74    (i)  to information and data known to the User at the time of
  75         receipt hereunder (as evidenced by its written records);
  76
  77   (ii)  to information and data which was at the time of receipt in the
  78         public domain or thereafter becomes so through no wrongful act of
  79         the User;
  80
  81  (iii)  to information and data which the User receives from a third
  82         party not in breach of any obligation of confidentiality owed to
  83         the Author(s).
  84
  85 10. The User understands that the Software is supplied "as is". No warranty
  86    as to its fitness or suitability for any purpose whatsoever is made or
  87    implied. In no event shall the Author(s) or Copyright holder be held
  88    responsible for any direct or indirect damages arising through the use
  89    of the Software.