Merge branch 'master' into namespaced

This is a no-op merge, explicitly considering and rejecting the
submodules from the master branch.  After this merge, future merges
from the master branch will pick up any content changes.

  $ git merge --log --no-ff --strategy ours master

* master:
  exercises/hearing: Replace 2012-04-uchichicago commit with 2012-02-trieste
  exercises/genotype: Add the genotype example submodule
  exercises/dictionary: Add the dictionary example submodule

exercises/hearing: Replace 2012-04-uchichicago commit with 2012-02-trieste

Replace the copy-paste bf93a25 (added data, 2012-03-20) from the
Chicago boot camp with the earlier 3e24204 (Added Da for Shell
example, 2012-01-30) from the Trieste boot camp [2].

[1]: https://github.com/thehackerwithin/UofCSCBC2012
[2]: https://github.com/thehackerwithin/PyTrieste

exercises/genotype: Add the genotype example submodule

Drop exercises from the submodule name in case we want to reorganize
later.  We won't have any other 'genotype' submodules.

exercises/dictionary: Add the dictionary example submodule

Drop exercises from the submodule name in case we want to reorganize
later.  We won't have any other 'dictionary' submodules.

Merge branch 'master' into HEAD

This is a no-op merge, explicitly considering and rejecting the
submodules from the master branch.  After this merge, future merges
from the master branch will pick up any content changes.

* master:
  exercises/hearing: Add the cochlear implant example submodule

Merge branch 'master' into namespaced

* master:
  instructor.md: Update hello path with deeper hello/hello nesting

exercises/hearing: Add the cochlear implant example submodule

Drop exercises from the submodule name in case we want to reorganize
later.  We won't have any other 'hearing' submodules.

Merge branch 'master' into namespaced

This is a no-op merge, explicitly considering and rejecting the
submodules from the master branch.  After this merge, future merges
from the master branch will pick up any content changes.

  $ git merge --log --no-ff --strategy ours master

* master:
  exercises/hello: Add the hello script example submodule

instructor.md: Update hello path with deeper hello/hello nesting

The hello script is at .../exercises/hello/hello now, not
.../exercises/hello, because .../exercises/hello is the submodule
directory.

exercises/hello: Add the hello script example submodule

Drop exercises from the submodule name in case we want to reorganize
later.  We won't have any other 'hello' submodules.

Merge branch 'master' into namespaced

This is a no-op merge, explicitly considering and rejecting the
de-namespacing from the master branch.  After this merge, future
merges from the master branch will pick up any content changes.

  $ git merge --log --no-ff --strategy ours master

* master:
  README.md: Remove nesting modular/shell/

README.md: Remove nesting modular/shell/

There's no need to hard-code target directories in this repository.
Anyone consuming this material can use submodules and pick their own
target directory.

modular/shell: Start reorganizing the shell material

Mostly split the examples out into their own directories with READMEs,
but there was a lot of editing to partially convert the long-form
notes into a condensed instructor.md targeted at instructors.  I've
gotten to the pipes section and run out of steam.  Erik may be taking
over the rest of the rewrite...

Merge branch 'cheat-sheet' into master

* cheat-sheet: (37 commits)
  Cheatsheet based on @LJWilliams's version (PR #30) with updates to match the Guide
  Update shell_cheatsheet.md
  Update shell_cheatsheet.md
  Update shell_cheatsheet.md
  ...

Changing 'git clone' URL in shell README to the read-only git:// URL.

It had been showing the HTTPS URL but about 50% of the time that would ask
people for their usernames and passwords even though they just wanted to clone.
The read-only URL should never involve username/password stuff.

Fix shell header

Made the title line into title markup and rephrased the intro title so that it make sense.

Added some words about the history command and bang-history # direct access.

Fix old typo on file size.

Clean up ambiguity between file and filename.

There is no executable in the boot-camps directory - need to cd to shell dir first.

remove some spaces getting in the way of bold

Seem to have the tables figured out - they need a header - annoying

Can we get some documentation on tables

A few more changes to be consistent and clear.

* q is for quit (mnemonics)
* tab completion seemed to have invalid examples/instructions
* made a table of less commands
* explained why less commands work in man
* redirection exercise was ambiguous: files that contain 4 in their contents, or whose names contain the number 4?
* mkdir is to 'make' a directory (mnemonics)
* combined sort exercise block

Some formatting and flow changes:

* try to bring formatting of subheadings into consistency by promoting all bolded headings to hierarchichal headings
* add Paul Wilson as author
* initial directory changing and git checkout flow was not consistent with following commands
* added excercise around man pages and ls
* added comment on mental model of directory hierarchy
* labeled exercise at end of path section
* clarified conditions under which different ls commands were equivalent

Update shell/Readme.md

Fix markup to highlight `find` command.

Update shell/Readme.md

Improve wording in `cp` file backup example.

Update shell/Readme.md

Fix typo and some missing words.

shell/Readme.md: Fix 'swsc' -> 'swc' typo

shell/Readme.md: Use USERNAME and YYYY-MM-PLACE in git clone instructions

fixed links

[wtk]:
This pulled in a few workshop-specific link changes, but I cherry
picked it to get the "GUI" -> "browser" update.

shell/Readme.md: use explicit URL (with https://)

Conversion of all rst to corresponding markdown files

We use git-flavoured markdown

W. Trevor King: I dropped everything from the original 4ba1cf2 except
for the shell/Readme.md modification.

removed references to 2013-01-chicago (those became YYYY-MM-PLACE) and thehackerwithin (those became USERNAME).

W. Trevor King: I dropped everything from the original 87034d8 except
for the shell/Readme.md modification.

removing links from readmes, removed old.md, not sure what that was.

W. Trevor King: I dropped everything from the original 500753d except
for the shell/Readme.md modification.

Fix one more s,Shell-1,shell,

Fix paths in shell section

fixes links in shell readme

Updated URL

Updated URL

Updated URL

Updated for Jan12th bootcamp

 moved a lot of files to folders that will mesh with the directory structure intended for the master branch, in case we merge this in. A bunch of things still need to be done. The software engineering section isn't completely moved and the readmes are still in rst rather than md.

W. Trevor King: I removed everything from the original 00149bc except
the 1-Shell -> shell move.

Fixed github URL.

Updated shell tutorial to reflect new VM.  Also minor
edits for clarity.  Added reference to xargs, command
history.

Corrected git command

Modified 1-Shell to use swc in place of thw and \nSWC-bootcamp in place of UofCSCBC2012 so as to have correct org and repo name.

Changed presenter name

Done with the shell tutorial...at last

More updates to shell tutorial

More updates to shell tutorial

More updates to shell tutorial

Added more to shell tutorial. Also added a hello world program

More updates

Added a bunch of new text to shell tutorial

More updates to shell section. Added first exercise!

More updates to shell section

Experimenting...

More updates to the shell section

Started just directly editing the Readme.md file

Testing to make sure I can use lists correctly

More updates

More updates to shell section

Updated shell section

Added acknowledgement

Added associated markdown files.

W. Trevor King: I removed everything from the original 7d32d4e except
the 1-Shell/Readme.md addition.

added lunch, schedule, etc.

W. Trevor King: I dropped everything from the original 47faad7 except
for the 1-Shell/Readme.rst addition.

Cheatsheet based on @LJWilliams's version (PR #30) with updates to match the Guide

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md

Update shell_cheatsheet.md