profiles: Mask sci-biology/{biojava,mauve,mauvealigner}
authorJames Le Cuirot <chewi@gentoo.org>
Sun, 7 Feb 2016 22:47:34 +0000 (22:47 +0000)
committerJames Le Cuirot <chewi@gentoo.org>
Sun, 7 Feb 2016 22:49:49 +0000 (22:49 +0000)
BioJava depends on commons-dbcp:0, which requires Java 6. Even the
latest "legacy" version 1.9.1 does so and no one wants to do the
difficult bump to 4.1.0. Mauve depends on BioJava but being a very
outdated live SVN ebuild, it probably doesn't work anyway. This goes
for Mauve Aligner too. Removal in 30 days. See bug #556470.

profiles/package.mask

index 6fd698cf7600f63e7da8675f9aff53dc35718b3c..964eb1c28e838c47876e65d3064cacee3b643939 100644 (file)
 
 #--- END OF EXAMPLES ---
 
+# James Le Cuirot <chewi@gentoo.org> (07 Feb 2016)
+# BioJava depends on commons-dbcp:0, which requires Java 6. Even the
+# latest "legacy" version 1.9.1 does so and no one wants to do the
+# difficult bump to 4.1.0. Mauve depends on BioJava but being a very
+# outdated live SVN ebuild, it probably doesn't work anyway. This goes
+# for Mauve Aligner too. Removal in 30 days. See bug #556470.
+sci-biology/biojava
+sci-biology/mauve
+sci-biology/mauvealigner
+
 # James Le Cuirot <chewi@gentoo.org> (07 Feb 2016)
 # Masked until 2.0 final arrives, which hopefully won't depend on
 # commons-dbcp:0 as that requires Java 6. Note that the 2.0 in the