test/zero_surface_contact_point_with_vibration.py

   1 # Copyright (C) 2010-2012 W. Trevor King <wking@drexel.edu>
   2 #
   3 # This file is part of Hooke.
   4 #
   5 # Hooke is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
   6 # terms of the GNU Lesser General Public License as published by the Free
   7 # Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any
   8 # later version.
   9 #
  10 # Hooke is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
  11 # WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
  12 # A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU Lesser General Public License for more
  13 # details.
  14 #
  15 # You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
  16 # along with Hooke.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17
  18 """
  19 Point data_logger to our test data.
  20
  21 >>> import os
  22 >>> import os.path
  23 >>> import data_logger
  24 >>> data_logger.DEFAULT_PATH = os.path.join(
  25 ...     os.getcwd(), 'test', 'data', 'vclamp_wtk')
  26
  27 Adjust Hooke in case we don't have calibcant installed.
  28
  29 >>> from hooke.hooke import Hooke, HookeRunner
  30 >>> h = Hooke()
  31 >>> h.config.set('wtk driver', 'cantilever calibration directory',
  32 ...              '${DEFAULT}/calibrate_cantilever')
  33 >>> h.load_drivers()
  34
  35 Proceed with the test itself.
  36
  37 >>> r = HookeRunner()
  38 >>> playlist = os.path.join('test', 'data', 'vclamp_wtk', 'playlist')
  39 >>> h = r.run_lines(h, ['load_playlist ' + playlist])
  40 <FilePlaylist WTK>
  41 Success
  42 <BLANKLINE>
  43 >>> h = r.run_lines(h, ['previous_curve'])
  44 Success
  45 <BLANKLINE>
  46 >>> h = r.run_lines(h, ['curve_info --enable-path'])
  47 ... # doctest: +ELLIPSIS, +REPORT_UDIFF
  48 path: .../test/data/vclamp_wtk/unfold/20100504/20100504151536_unfold
  49 Success
  50 <BLANKLINE>
  51 >>> h = r.run_lines(h, ['zero_surface_contact_point --block retract'])
  52 ... # doctest: +ELLIPSIS, +REPORT_UDIFF
  53 {'active fitted parameters': array([ 1.04...,  1.12...,  0.91...]),
  54  'active parameters': array([ 1.04...,  1.12...,  0.91...]),
  55  'convergence flag': ...,
  56  'covariance matrix': array(...),
  57  'data scale factor': Data(3.95...e-08),
  58  'fitted parameters': [-8.3...e-08,
  59                        4.6...e-11,
  60                        2875.7...],
  61  'info': {...},
  62  'initial parameters': [-8.0...e-08,
  63                         4.1...e-11,
  64                         3149.2...],
  65  'message': '...',
  66  'rescaled': True,
  67  'scale': None}
  68 Success
  69 <BLANKLINE>
  70 """