test/zero_surface_contact_point_with_vibration.py

   1 # Copyright (C) 2010 W. Trevor King <wking@drexel.edu>
   2 #
   3 # This file is part of Hooke.
   4 #
   5 # Hooke is free software: you can redistribute it and/or modify it
   6 # under the terms of the GNU Lesser General Public License as
   7 # published by the Free Software Foundation, either version 3 of the
   8 # License, or (at your option) any later version.
   9 #
  10 # Hooke is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
  11 # ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY
  12 # or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU Lesser General
  13 # Public License for more details.
  14 #
  15 # You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  16 # License along with Hooke.  If not, see
  17 # <http://www.gnu.org/licenses/>.
  18
  19 """
  20 Point data_logger to our test data.
  21
  22 >>> import os
  23 >>> import os.path
  24 >>> import data_logger
  25 >>> data_logger.DEFAULT_PATH = os.path.join(
  26 ...     os.getcwd(), 'test', 'data', 'vclamp_wtk')
  27
  28 Adjust Hooke in case we don't have calibcant installed.
  29
  30 >>> from hooke.hooke import Hooke, HookeRunner
  31 >>> h = Hooke()
  32 >>> h.config.set('wtk driver', 'cantilever calibration directory',
  33 ...              '${DEFAULT}/calibrate_cantilever')
  34 >>> h.load_drivers()
  35
  36 Proceed with the test itself.
  37
  38 >>> r = HookeRunner()
  39 >>> playlist = os.path.join('test', 'data', 'vclamp_wtk', 'playlist')
  40 >>> h = r.run_lines(h, ['load_playlist ' + playlist])
  41 <FilePlaylist WTK>
  42 Success
  43 <BLANKLINE>
  44 >>> h = r.run_lines(h, ['previous_curve'])
  45 Success
  46 <BLANKLINE>
  47 >>> h = r.run_lines(h, ['curve_info --enable-path'])
  48 ... # doctest: +ELLIPSIS, +REPORT_UDIFF
  49 path: .../test/data/vclamp_wtk/unfold/20100504/20100504151536_unfold
  50 Success
  51 <BLANKLINE>
  52 >>> h = r.run_lines(h, ['zero_surface_contact_point --block retract'])
  53 ... # doctest: +ELLIPSIS, +REPORT_UDIFF
  54 {'active fitted parameters': array([ 1.04...,  1.12...,  0.91...]),
  55  'active parameters': array([ 1.04...,  1.12...,  0.91...]),
  56  'convergence flag': ...,
  57  'covariance matrix': array(...),
  58  'data scale factor': Data(3.95...e-08),
  59  'fitted parameters': [-8.3...e-08,
  60                        4.6...e-11,
  61                        2875.7...],
  62  'info': {...},
  63  'initial parameters': [-8.0...e-08,
  64                         4.1...e-11,
  65                         3149.2...],
  66  'message': '...',
  67  'rescaled': True,
  68  'scale': None}
  69 Success
  70 <BLANKLINE>
  71 """