test/flat_filter_peaks.py

   1 # Copyright (C) 2010-2012 W. Trevor King <wking@drexel.edu>
   2 #
   3 # This file is part of Hooke.
   4 #
   5 # Hooke is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
   6 # terms of the GNU Lesser General Public License as published by the Free
   7 # Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any
   8 # later version.
   9 #
  10 # Hooke is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
  11 # WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
  12 # A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU Lesser General Public License for more
  13 # details.
  14 #
  15 # You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
  16 # along with Hooke.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17
  18 """
  19 >>> from hooke.hooke import Hooke, HookeRunner
  20 >>> h = Hooke()
  21 >>> r = HookeRunner()
  22 >>> h = r.run_lines(h, ['load_playlist test/data/test']) # doctest: +ELLIPSIS
  23 <FilePlaylist test.hkp>
  24 Success
  25 <BLANKLINE>
  26 >>> h = r.run_lines(h,
  27 ...     ['zero_surface_contact_point --block retract']
  28 ...     ) # doctest: +ELLIPSIS, +REPORT_UDIFF
  29 {'active fitted parameters':...}
  30 Success
  31 <BLANKLINE>
  32 >>> h = r.run_lines(h, ['flat_filter_peaks --block retract']
  33 ...     ) # doctest: +ELLIPSIS
  34 [<Peak flat filter peak 0 of surface deflection 610 [ -1.156...e-09  -8.840...e-10  -3.173...e-10  -7.480...e-10]>]
  35 Success
  36 <BLANKLINE>
  37 >>> curve = h.playlists.current().current()
  38 >>> retract = curve.data[-1]
  39 >>> retract.info['flat filter peaks']  # doctest: +ELLIPSIS
  40 [<Peak flat filter peak 0 of surface deflection 610 [ -1.156...e-09  -8.840...e-10  -3.173...e-10  -7.480...e-10]>]
  41 >>> retract.info['columns']
  42 ['z piezo (m)', 'deflection (m)', 'surface distance (m)', 'surface deflection (m)', 'flat filter peaks (m)']
  43 >>> retract[:5,-1]  # doctest: +ELLIPSIS
  44 Data([-0., -0., -0., -0., -0.])
  45 >>> retract[609:615,-1]  # doctest: +ELLIPSIS
  46 Data([  0.000...e+00,   2.380...e-09,   9.747...e-10,
  47         -2.266...e-10,   9.071...e-11,  -0.000...e+00])
  48 >>> retract[-5:,-1]  # doctest: +ELLIPSIS
  49 Data([-0., -0., -0., -0., -0.])
  50 """