calibcant/config.py

   1 # calibcant - tools for thermally calibrating AFM cantilevers
   2 #
   3 # Copyright (C) 2007,2008, William Trevor King
   4 #
   5 # This program is free software; you can redistribute it and/or
   6 # modify it under the terms of the GNU General Public License as
   7 # published by the Free Software Foundation; either version 3 of the
   8 # License, or (at your option) any later version.
   9 #
  10 # This program is distributed in the hope that it will be useful, but
  11 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.
  13 # See the GNU General Public License for more details.
  14 #
  15 # You should have received a copy of the GNU General Public License
  16 # along with this program; if not, write to the Free Software
  17 # Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA
  18 # 02111-1307, USA.
  19 #
  20 # The author may be contacted at <wking@drexel.edu> on the Internet, or
  21 # write to Trevor King, Drexel University, Physics Dept., 3141 Chestnut St.,
  22 # Philadelphia PA 19104, USA.
  23
  24 """Define some variables to configure the package for a particular lab
  25 and workflow."""
  26
  27 import z_piezo
  28
  29 DEFAULT_TEMP = 22  # assume 22 deg C
  30 LOG_DATA = True  # quietly grab all real-world data and log to LOG_DIR
  31 LOG_DIR = '$DEFAULT$/calibrate_cantilever'
  32 GNUFIT_DATA_BASE='./calibrate_cantilever_fitdata'
  33 TEXT_VERBOSE = True      # for debugging
  34 GNUPLOT_VERBOSE = True   # turn on fit check plotting
  35 PYLAB_VERBOSE = False    # turn on plotting
  36 PYLAB_INTERACTIVE = True # select between draw() and show() for flushing plots
  37 BASE_FIGNUM = 20 # to avoid writing to already existing figures
  38
  39
  40 # HACK
  41 # make sure you make a system note (add_system_note) if you change
  42 # these in case you don't have access to a z_piezo for conversion
  43 # functions
  44
  45 # zpGain      zpiezo applied voltage per output Volt
  46 zpGain = z_piezo.DEFAULT_GAIN
  47 # zpSensitivity  nm zpiezo response per applied Volt
  48 zpSensitivity = z_piezo.DEFAULT_SENSITIVITY
  49 # Vzp_out2V   function that converts output DAC bits to Volts
  50 Vzp_out2V = z_piezo.DEFAULT_VZP_OUT_2_VOLTS
  51 # Vphoto_in2V function that converts input ADC bits to Volts
  52 Vphoto_in2V = z_piezo.DEFAULT_VPHOTO_IN_2_VOLTS
  53 # zeroVphoto_bits  ADC bit output for a 0V input
  54 zeroVphoto_bits = z_piezo.DEFAULT_ZERO_PHOTODIODE_BITS