Removed old references to freq in calibrate.py after freq->push_speed change.

Also turned plotting back on by default (the change doesn't affect
command line usage).

Start bumps with the cantilever _off_ the surface.

Photodiode sensitivity (and thus, bump slope) decreases as the
zero-deflection photodiode input moves away from zero Volts.  In order
to mitigate the effect of this on our calibration, we need to keep
track of the zero-deflection signal.  By starting our bump off the
surface, our bumps should always start and end in the zero-deflection
regime.

This will make analysis a bit more complicated though.  I'll get to
that next.

Control bump_speed instead of bump sample frequency.

More physically useful number.  The old default speed was huge.

Prepared for distribution.

Fixed lines in the Makefile that I hadn't changed when I copied it into
this project in the beginning.  Also added GPL blurbs to two py files.

New Marisa/me calibration difference bug 327f4db8-3119-4ec1-a762-a3115254608a

Apply some fixes to get calibrations working and bump version.

Mostly namespace problems due to `from numpy import *` and the
like.  Things seem to work now.  I think we're ready for prime-time.

calibrate.py should now work.

A bunch of changes in one commit, sorry.

Moved to fledgling splittable_kwargs system to make default argument
maintenance easier.  I expect the splittable_kwargs system still has
some growing to do, but it's already better than the old system.

Merged BE database from the calibcant subdir into the main BE database.
It was a mistake to create the database there in the first place.

Began versioning.