Revert "ruby: Add workarounds to use in-tree build not the installed one"

This reverts commit 82b73ffd7380b85d259eeb91100dd6ac2d14223a.

Only leave the copyright changes.

Signed-off-by: Felipe Contreras <felipe.contreras@gmail.com>
(cherry picked from commit 35cb1c95cc8afa964900d29c813349ad8e24e7a8)

debian: changelog stanza for 0.13.1

version: bump to 0.13.1

fix release date for 0.13.1

NEWS for directory function fixes

NEWS: started 0.13.1 stanza: fix decoding of text/plain parts in reply

NEWS item for forthcoming 0.13.1 bug fix release: UTF-8 characters were
incorrectly decoded when inserting reply content from text/plain parts.

lib: Don't needlessly create directory docs in _notmuch_message_remove_filename

Previously, if passed a filename with a directory that did not exist
in the database, _notmuch_message_remove_filename would needlessly
create that directory document.  Fix it so that doesn't happen.

python: Remove find_message_by_filename workaround

Now that notmuch_database_find_message_by_filename works on read-only
databases, remove the workaround that disabled it on read-write
databases.

This also adds a regression test for find_message_by_filename.

lib: Make notmuch_database_find_message_by_filename not crash on read-only databases

Previously, _notmuch_database_filename_to_direntry would abort with an
internal error when called on a read-only database.  Now that creating
the directory document is optional,
notmuch_database_find_message_by_filename can disable directory
document creation (as it should) and, as a result, not abort on
read-only databases.

python: Update Database.get_directory documentation

notmuch_database_get_directory no longer returns an error for
read-only databases, so remove ReadOnlyDatabaseError from the list of
get_directory exceptions.

new: Remove workaround for detecting newly created directory objects

Previously, notmuch_database_get_directory did not indicate whether or
not the returned directory object was newly created, which required a
workaround to distinguish newly created directory objects with no
child messages from directory objects that had no mtime set but did
have child messages.  Now that notmuch_database_get_directory
distinguishes whether or not the directory object exists in the
database, this workaround is no longer necessary.

lib: Make notmuch_database_get_directory return NULL if the directory is not found

Using the new support from _notmuch_directory_create, this makes
notmuch_database_get_directory a read-only operation that simply
returns the directory object if it exists or NULL otherwise.  This
also means that notmuch_database_get_directory can work on read-only
databases.

This change breaks the directory mtime workaround in notmuch-new.c by
fixing the exact issue it was working around.  This permits mtime
update races to prevent scans of changed directories, which
non-deterministically breaks a few tests.  The next patch fixes this.

lib: Perform the same transformation to _notmuch_database_filename_to_direntry

Now _notmuch_database_filename_to_direntry takes a flags argument and
can indicate if the necessary directory documents do not exist.
Again, callers have been updated, but retain their original behavior.

lib: Perform the same transformation to _notmuch_database_find_directory_id

Now _notmuch_database_find_directory_id takes a flags argument, which
it passes through to _notmuch_directory_create and can indicate if the
directory does not exist.  Again, callers have been updated, but
retain their original behavior.

lib: Make directory document creation optional for _notmuch_directory_create

Previously this function would create directory documents if they
didn't exist.  As a result, it could only be used on writable
databases.  This adds an argument to make creation optional and to
make this function work on read-only databases.  We use a flag
argument to avoid a bare boolean and to permit future expansion.

Both callers have been updated, but currently retain the old behavior.
We'll take advantage of the new argument in the following patches.

emacs: use 'gnus-decoded in notmuch-mm-display-part-inline ()

When mail message is read from emacs, the message structure
obtained may contain parts which have content included
(`text/plain` for example) and other parts where content is not
included (`text/html` for example).

In case content is included, the string is already available in
emacs' internal format and therefore mm-... functions should not
attempt to do further decoding for the data in temp buffer
provided for it.

Currently when reply buffer is created,
notmuch-mm-display-part-inline () is used to provided quoted reply
content. This change makes the mm-... functions called by it use
'gnus-decoded as charset whenever the content is already available.

File .../emacs-23.3/lisp/gnus/mm-uu.el mentions:
"`gnus-decoded' is a fake charset, which means no further decoding."

debian: fix typo in changelog.

the path for NEWS was wrong
(cherry picked from commit b9520ef033ea9ae54507f94f7258641a6a1ad2e6)

NEWS: Capitalized go bindings changes title

Align 'Go bindings changes' title capitalization to rest of the file

NEWS: Insert markdown formatting commands in 0.13 section text

NEWS entries in section 0.13 is brought consistent with rest of the
NEWS file.

NEWS: Changed 0.13 release date in NEWS file to 2012-05-15

NEWS: Dropped old 'Reply to sender' section

'Reply to sender' section was 0.12 news which was accidentally
duplicated in 0.13 news

debian: changelog stanza for 0.13

My usual lazy self, refer to upstream NEWS.

version: bump to 0.13

add NEWS item about new emacs tagging interface.

This is fairly important to mention, since it represents a user
interface change.

debian: recommend notmuch-mutt as an alternative user interface

Recommend all notmuch UI (including notmuch-mutt) as alternatives, to
avoid unneeded vim/emacs installation.

Thanks Matteo F. Vescovi for the patch.

Closes: #673011

news: Update for changes to notmuch_database_get_directory

ruby: Update for changes to notmuch_database_get_directory

python: Update for changes to notmuch_database_get_directory

notmuch_database_get_directory now returns
NOTMUCH_STATUS_READ_ONLY_DATABASE on its own (rather than crashing) so
the workaround in Database.get_directory is no longer necessary.

go: Update for changes to notmuch_database_get_directory

lib/cli: Make notmuch_database_get_directory return a status code

Previously, notmuch_database_get_directory had no way to indicate how
it had failed.  This changes its prototype to return a status code and
set an out-argument to the retrieved directory, like similar functions
in the library API.  This does *not* change its currently broken
behavior of creating directory objects when they don't exist, but it
does document it and paves the way for fixing this.  Also, it can now
check for a read-only database and return
NOTMUCH_STATUS_READ_ONLY_DATABASE instead of crashing.

In the interest of atomicity, this also updates calls from the CLI so
that notmuch still compiles.

NEWS: add an entry for the go 1 compatibility

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

go: format the souce code using gofmt

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

go: update the build system

The new "go" utility does not require any Makefiles to compile go
packages and programs. Remove the old Makefiles and replace the top
level Makefile with one defining some convenience targets for
compiling the notmuch bindings and the notmuch-addrlookup utility.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

go: update the addrlookup utility to go 1

Use the new built in error type that replaces os.Error, adapt the code
to the fact that strings.Split has just two arguments now.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

go: set LDFLAGS to -lnotmuch in the packages source file

Set the LDFLAGS to -lnotmuch so the resulting go package will be
linked with libnotmuch.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

go: reorganize the go bindings

go 1 introduced the "go" program that simplifies building of libraries
and programs. This patch reorganizes the go code so it can be compiled
using the new utility, it does not change any files.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

go: define the constant STATUS_UNBALANCED_ATOMIC

Add the constant STATUS_UNBALANCED_ATOMIC to the list of notmuch
status codes.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

go: fix the notmuch status constants

Formerly all the constants were set to zero since in golang constants
are set to the previous value if no new value is specified. Use the
iota operator that is incremented after each use to fix this issue.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

go: update notmuch-addrlookup to the new API

notmuch.OpenDatabase now returns a status indicating success or
failure. Use this information to inform the user of any failures.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

debian: fix suite

Since I already pushed a tag 0.13_rc-1, let's just increment the
debian version to keep everything tidy.

bump version to 0.13~rc1

ruby: Add wrapper for notmuch_query_set_omit_excluded()

ruby: Add workarounds to use in-tree build not the installed one

- Make mkmf use the notmuch.h under ../../lib
- Use libnotmuch.a instead of linking to the installed libnotmuch.so

ruby: Add wrapper for notmuch_query_add_tag_exclude

ruby: Add wrapper for notmuch_query_count_messages

emacs: fix custom queries section customization widget in notmuch-hello

The customization widget referred to a non-existing function
`notmuch-hello-insert-query-list'.  The patch changes it to the
correct one - `notmuch-hello-insert-searches'.  The relevant test is
fixed now.

test: add Emacs notmuch-hello tests for custom tags and queries section.

The tests use default values from customization widgets to make sure
that these customization widgets work (at least on basic level).

The custom queries section test is currently broken.

test: Force reply to use html2text for consistency

The output of the HTML reply test in the emacs suite can vary
depending on which HTML renderers are installed on the machine running
the tests. The renderer that is always available is emacs's builtin
html2text function. In order to get consistency, force the test to use
html2text even if other renderers are available.

emacs: Do not pass stderr of notmuch reply to JSON parser

Sometimes, notmuch reply outputs something to stderr, for example:
"Failed to verify signed part: Cannot verify multipart/signed part:
unsupported signature protocol". When this happens, replying in emacs
fails, because emacs cannot parse the error message as JSON.

This patch causes emacs to ignore stderr when reading reply from
notmuch.

emacs: Let the user choose where to compose new mails

Introduce a new defcustom notmuch-mua-compose-in that allows users to
specify where new mails are composed, either in the current window or
in a new window or frame.

Signed-off-by: Jameson Rollins <jrollins@finestructure.net>

emacs: Correctly quote non-text/plain parts in reply

Quote non-text parts nicely by displaying them with mm-display-part
before calling message-cite-original to quote them. HTML-only emails
can now be quoted correctly. We re-use some code from notmuch-show
(notmuch-show-mm-display-part-inline), which has been moved to
notmuch-lib.el.

Mark the test for this feature as not broken.

test: Replying to an HTML-only message in emacs

With the latest reply infrastructure, we should be able to nicely
quote HTML-only emails. But currently emacs quotes the raw HTML
instead of parsing it first. This commit adds a test for this case.

This test currently marked as broken.

debian: add notmuch_query_set_omit_excluded to symbols file.

This symbol is apparently part of the exclude code that was disabled
for 0.12.

debian: update packaging for new soname libnotmuch.so.3

we need
   - a new changelog stanza, because the symbols files need a new version
   - s/libnotmuch2/libnotmuch3/ everywhere
   - update symbols file, s/.so.1/.so.2/, and bump minimum versions on changed
     symbols (although the latter is just documentation)

debian: start changelog stanza for 0.13~rc1-1

This is mainly so that the soname bump in the debian symbols file
makes sense.

lib: Bump SO version from 2.0.0 to 3.0.0

We've changed the APIs of notmuch_database_open,
notmuch_database_create, and notmuch_database_close.

Amended by db: also bump string in bindings/python/notmuch/globals.py

News for changes to notmuch_database_{open,create}

ruby: Update Ruby bindings for new notmuch_database_{open, create} signatures

python: Update Python bindings for new notmuch_database_{open, create} signatures

go: Update Go bindings for new notmuch_database_{open, create} signatures

This requires changing the return types of NewDatabase and
OpenDatabase to follow the standard Go convention for returning
errors.

lib/cli: Make notmuch_database_create return a status code

This is the notmuch_database_create equivalent of the previous change.

In this case, there were places where errors were not being propagated
correctly in notmuch_database_create or in calls to it.  These have
been fixed, using the new status value.

lib/cli: Make notmuch_database_open return a status code

It has been a long-standing issue that notmuch_database_open doesn't
return any indication of why it failed.  This patch changes its
prototype to return a notmuch_status_t and set an out-argument to the
database itself, like other functions that return both a status and an
object.

In the interest of atomicity, this also updates every use in the CLI
so that notmuch still compiles.  Since this patch does not update the
bindings, the Python bindings test fails.

NEWS: Insert markdown formatting commands

To make updating the notmuchmail.org wiki 'news' section more
straightforward the content of the NEWS file has now been brought
to almost the same as the *.mdwn files in the wiki page.

The changes are basically insertion of mdwn formatting "commands".

More effort has been put into formatting the newer release entries
(0.12, 0.11 & 0.10) than older. Commit to format 0.13 entries will
be made available separately.

NEWS: spacing changes

With these whitespace changes the spacing looks generally
the same throughout the whole file.

NEWS: untabified and added file local variables block

Changed all tabs to 8 spaces (M-x untabify over region of the
whole file).

Now this looks uniformly on all viewers (using fixed-width font)
and the observed difference between this "source" file and markdown
generated html output on browser window is smaller. In markdown to
html conversions tab and 8 spaces indents differently.

Also the "Local variables:" block added to the end of this file
attempts to ensure tabs are always expanded; whether the used editor
is Emacs or Vi.

go: Update to the current notmuch_database_find_message API

The signature of notmuch_database_find_message was changed in 02a30767
to report errors and the Go bindings were never updated.  This brings
the Go bindings in sync with that change and at least makes them
compile with Go r60.3, the last release before Go 1.

python: remove a note stating wrong things about the memory management

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: document the Database.close function

Put a prominent warning into the docstring of Database.close, make the
function show up in the sphinx doc and refer to the warning in the
paragraph mentioning the context manager protocol.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: deprecate code formatting messages as text and json

This code adds functionality at the python level that is unlikely to
be useful for anyone. Furthermore the python bindings strive to be a
thin wrapper around libnotmuch, so this code will be removed in
notmuch 0.14.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: cleanup the __nonzero__ implementations

Cleanup the code, reword the docstring and use the same implementation
in the Threads, Tags and Messages classes.

__nonzero__ implements truth value testing. If __nonzero__ is not
implemented, the python runtime would fall back to `len(..) > 0` thus
exhausting the iterator.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: fix NULL pointer tests

Fix the NULL pointer tests in the destructors of all classes and
Database.create.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: update the docstrings of Filenames.{__len__,__unicode}

Formerly the documentation was overly verbose. Reword the comment and
use the same for both functions.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: update the docstring of class Filenames

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: fix the documentation

Remove the reference to Filenames.as_generator in the sphinx
documentation.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: fix Message.get_filenames

Do not to use the removed function Filenames.as_iterator.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: remove the deprecated function Filenames.as_generator

Remove the function Filenames.as_generator that has been marked as
deprecated in 0.12.

The class Filenames implements the iterator protocol so you can
directly iterate over such objects instead.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

emacs: eliminate search-tag-thread in favor of just search-tag

notmuch-search-tag-thread is now completely redundant with
notmuch-search-tag so we eliminate it to simplify the interface.

emacs: modify show tag functions to use new notmuch-tag interface

The main change here is to modify argument parsing so as to not force
tag-changes to be a list, and to let notmuch-tag handle prompting the
user when required.  doc strings are also updated and cleaned up.

emacs: modify search tag functions to use new notmuch-tag interface

The main change here is to modify argument parsing so as to not force
tag-changes to be a list, and to let notmuch-tag handle prompting the
user when required.  doc strings are also updated and cleaned up.

emacs: allow notmuch-tag to accept string inputs and prompt for tags

notmuch-tag is extended to accept various formats of the tag changes.
In particular, user prompting for tag changes is now incorporated
here, so it is common for modes.

The tag binary and the notmuch-{before,after}-tag-hooks are only
called if tag changes is non-nil.

In all cases tag-changes is returned as a list.

emacs: create notmuch-tag.el, and move appropriate functions from notmuch.el

Tagging functions are used in notmuch.el, notmuch-show.el, and
notmuch-message.el.  There are enough common functions for tagging
that it makes sense to put them all in their own library.

No code is modified, just moved around.

emacs: fix archive thread/message function documentation.

This removes an inaccuracy in the thread archiving function, and adds
a clarification to the message archiving function.

emacs: Don't move to the next thread unless the cursor is at the end of the buffer.

When using the spacebar to scroll through a thread, hitting 'space'
when the bottom of the last message is visible should take the cursor
to the end of the buffer rather than immediately archiving the thread
and moving to the next thread.

emacs-show: open excluded matches if no other matches

Currently emacs show does not open matching but excluded
messages. This is normally the desired behaviour but is probably not
ideal if only excluded messages match. This patch opens all the
matching (necessarily excluded) messages in this case and goes to the
first one.

NEWS: add news item for 'config list'

python: strip superfluous single quote from copyright notices

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: add copyright and licensing information to setup.py

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: stylistic and pep8 fixes in setup.py
Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: update the long description in setup.py

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: fix the test asserting that reading the version succeeded

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: simplify a path expression in setup.py

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

python: Remove unused import from setup.py

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

emacs: do not modify subject in search or show

A previous patch [0] replaced blank subject lines with '[No Subject]'
in search and show mode.  Apparently this was needed to circumvent
some bug in the printing code, but there was no need for it search or
show, and it is definitely not desirable, so we undo it here (a revert
is no longer feasible).  We should not be modifying strings in the
original message without good reason, or without a clear indication
that we are doing so, neither of which apply in this case.  For
further discussion see [0].

[0] id:"1327918561-16245-3-git-send-email-dme@dme.org"

man: Document 'config list' command

Document the 'config list' command and its output.

config: Add 'config list' command

Add a command to list all configuration items with their associated
values.

One use is as follows: a MUA may prefer to store data in a central
notmuch configuration file so that the data is accessible across
different machines, e.g. an addressbook.  The list command helps
to implement features such as tab completion on the keys.

test: Add broken test for 'config list'

Proposed functionality.

test: Add tests for 'config' command

Start a new test script.

config: Check 'config get' arity exactly

Require that 'config get' is passed exactly one additional argument,
instead of silently ignoring extra arguments. As a side-effect, produce
more specific error messages for the 'config' command as a whole.

python: wrap and use notmuch_database_destroy as destructor

Adapt the python bindings to the notmuch_database_close split.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>

ruby: Use notmuch_database_destroy instead of notmuch_database_close

Adapt the ruby bindings to the notmuch_database_close split.

Signed-off-by: Justus Winter <4winter@informatik.uni-hamburg.de>