Merge branch 'bw/autoconf'

* bw/autoconf:
  configure: rework pthread handling to allow for user defined flags
  configure: make iconv tests aware of user arguments
  configure: asciidoc version test cleanup
  configure: wrap some library tests with GIT_STASH_FLAGS
  configure: add macros to stash FLAG variables
  configure: reorganize flow of argument checks
  configure: ensure settings from user are also usable in the script

Merge branch 'xx/db-refspec-vs-js-remote'

* xx/db-refspec-vs-js-remote:
  Support '*' in the middle of a refspec
  Keep '*' in pattern refspecs
  Use the matching function to generate the match results
  Use a single function to match names against patterns
  Make clone parse the default refspec with the normal code

Merge branch 'jc/clone-branch-rebase'

* jc/clone-branch-rebase:
  Improve "git branch --tracking" output
  Make git-clone respect branch.autosetuprebase

Conflicts:
builtin-clone.c

Merge branch 'js/rebase-i-opt'

* js/rebase-i-opt:
  rebase -i: avoid 'git reset' when possible

Merge branch 'fc/parseopt-config'

* fc/parseopt-config:
  config: test for --replace-all with one argument and fix documentation.
  config: set help text for --bool-or-int
  git config: don't allow --get-color* and variable type
  git config: don't allow extra arguments for -e or -l.
  git config: don't allow multiple variable types
  git config: don't allow multiple config file locations
  git config: reorganize to use parseopt
  git config: reorganize get_color*
  git config: trivial rename in preparation for parseopt
  git_config(): not having a per-repo config file is not an error

Microoptimize strbuf_cmp

It can be less object code and may be even faster, even if at the
moment there is no callers to take an advantage of that. This
implementation can be trivially made inlinable later.

Signed-off-by: Alex Riesen <raa.lkml@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Produce a nicer output in case of sha1_object_info failures in ls-tree -l

An error message is already printed by sha1_object_info itself, and
the failed entries are additionally marked in the listing.

Signed-off-by: Alex Riesen <raa.lkml@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

import-tars: separate author from committer

The import-tars script is typically employed to (re)create the past
history of a project from stored tars. Although assigning authorship in
these cases can be a somewhat arbitrary process, it makes sense to set
the author to whoever created the tars in the first place (if it's
known), and (s)he can in general be different from the committer
(whoever is running the script).

Implement this by having separate author and committer data, making them
settable from the usual GIT_* environment variables.

Acked-by: Shawn O. Pearce <spearce@spearce.org>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'js/windows-tests'

* js/windows-tests:
  t5602: Work around path mangling on MSYS
  t5300, t5302, t5303: Do not use /dev/zero
  t2200, t7004: Avoid glob pattern that also matches files
  t7300: fix clean up on Windows
  test-lib: Introduce test_chmod and use it instead of update-index --chmod
  test-lib: Simplify test counting.
  test-lib: Replace uses of $(expr ...) by POSIX shell features.
  Call 'say' outside test_expect_success
  test suite: Use 'say' to say something instead of 'test_expect_success'
  t9400, t9401: Do not force hard-linked clone

t5602: Work around path mangling on MSYS

MSYS's bash rewrites /something/bin/... into a Windows path that looks like
c:/msysgit/something/bin/... before git sees it. But later the test case
verifies that the path was used and compares it to the unmangled version.
This fails, of course. This make the path relative so that the path
mangling is not triggered.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

t5300, t5302, t5303: Do not use /dev/zero

We do not have /dev/zero on Windows. This replaces it by data generated
with printf, perl, or echo. Most of the cases do not depend on that the
data is a stream of zero bytes, so we use something printable; nor is an
unlimited stream of data needed, so we produce only as many bytes as the
test cases need.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

t2200, t7004: Avoid glob pattern that also matches files

On Windows, there is an unfortunate interaction between the MSYS bash and
git's command line processing:

- Since Windows's CMD does not do the wildcard expansion, but passes
  arguments like path* through to the programs, the programs must do the
  expansion themselves. This happens in the startup code before main() is
  entered.

- bash, however, passes the argument "path*" to git, assuming that git will
  see the unquoted word unchanged as a single argument.

But actually git expands the unquoted word before main() is entered.

In t2200, not all names that the test case is interested in exist as files
at the time when 'git ls-files' is invoked. git expands "path?" to only
the subset of files the exist, and only that subset was listed, so that the
test failed.  We now list all interesting paths explicitly.

In t7004, git exanded the pattern "*a*" to "actual" (the file that stdout
was redirected to), which is not what the was tested for. We fix it by
renaming the output file (and removing any existing files matching *a*).
This was originally fixed by Johannes Schindelin.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

t7300: fix clean up on Windows

On Windows, you cannot remove files that are in use, not even with
'rm -rf'.  So we need to run 'exec <foo/bar' inside a subshell lest
removing the whole test repository fail.

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

test-lib: Introduce test_chmod and use it instead of update-index --chmod

This function replaces sequences of 'chmod +x' and 'git update-index
--chmod=+x' in the test suite, whose purpose is to help filesystems
that need core.filemode=false. Two places where only 'chmod +x' was used
we also use this new function.

The function calls 'git update-index --chmod' without checking
core.filemode (unlike some of the call sites did). We do this because the
call sites *expect* that the executable bit ends up in the index (ie. it
is not the purpose of the call sites to *test* whether git treats
'chmod +x' and 'update-index --chmod=+x' correctly). Therefore, on
filesystems with core.filemode=true the 'git update-index --chmod' is a
no-op.

The function uses --add with update-index to help one call site in
t6031-merge-recursive. It makes no difference for the other callers.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

test-lib: Simplify test counting.

Since the test case counter was incremented very late, there were a few
users of the counter had to do their own incrementing. Now we increment it
early and simplify these users.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

test-lib: Replace uses of $(expr ...) by POSIX shell features.

In particular:

- Test case counting can be achieved by arithmetic expansion.

- The name of the test, e.g. t1234, can be computed with ${0%%} and ${0##}.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

Call 'say' outside test_expect_success

There were some uses of 'say' inside test_expect_success. But if the tests
were not run in verbose mode, this message went to /dev/null. Pull them out
of test_expect_success.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

test suite: Use 'say' to say something instead of 'test_expect_success'

Some tests report that some tests will be skipped.  They used
'test_expect_success' with a trivially successful test.  Nowadays we have
the helper function 'say' for this purpose.

In on case, 'say_color skip' is replaced by 'say' because the former is
not intended as a public API.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

rebase: add options passed to git-am

Add the options --committer-date-is-author-date and --ignore-date
to git-rebase. They were introduced in commit a79ec62d0 for git-am.
These options imply --force-rebase.

Signed-off-by: Michele Ballabio <barra_cuda@katamail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

document --force-rebase

Signed-off-by: Michele Ballabio <barra_cuda@katamail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

MinGW: implement mmap

Add USE_WIN32_MMAP which triggers the use of windows' native
file memory mapping functionality in git_mmap()/git_munmap() functions.

As git functions currently use mmap with MAP_PRIVATE set only, this
implementation supports only that mode for now.

On Windows, offsets for memory mapped files need to match the allocation
granularity. Take this into account when calculating the packed git-
windowsize and file offsets. At the moment, the only function which makes
use of offsets in conjunction with mmap is use_pack() in sha1-file.c.

Git fast-import's code path tries to map a portion of the temporary
packfile that exceeds the current filesize, i.e. offset+length is
greater than the filesize. The NO_MMAP code worked with that since pread()
just reads the file content until EOF and returns gracefully, while
MapViewOfFile() aborts the mapping and returns 'Access Denied'.
Working around that by determining the filesize and adjusting the length
parameter.

Signed-off-by: Janos Laube <janos.dev@gmail.com>
Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

gc --aggressive: make it really aggressive

The default was not to change the window or depth at all.  As suggested
by Jon Smirl, Linus Torvalds and others, default to

--window=250 --depth=250

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Acked-by: Nicolas Pitre <nico@cam.org>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

git log: avoid segfault with --all-match

Avoid a segfault when the command

git log --all-match

was issued, by ignoring the option.

Signed-off-by: Michele Ballabio <barra_cuda@katamail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

apply: hide unused options from short help

The options "--binary" and "--allow-binary-replacement" of
git-apply are no-op and maintained for backward compatibility,
so avoid to show them in the short help screen.

Signed-off-by: Michele Ballabio <barra_cuda@katamail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

apply: consistent spelling of "don't"

Signed-off-by: Michele Ballabio <barra_cuda@katamail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

format-patch: Respect --quiet option

Hide the patch filename output from 'git format-patch' when --quiet
is used.  The man pages suggested that this should have already worked.

Signed-off-by: Nate Case <ncase@xes-inc.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

t9400, t9401: Do not force hard-linked clone

The tests do not depend on that the clones are hard-linked, but used
--local only as an optimization: At the time that --local was used first
in t9400 hard-linked clones were not the default, yet.

By removing --local, we help filesystems that do not support hard-links.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>

Update draft release notes to 1.6.3

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'jc/maint-1.6.0-read-tree-overlay'

* jc/maint-1.6.0-read-tree-overlay:
  read-tree A B C: do not create a bogus index and do not segfault

Merge branch 'db/maint-missing-origin'

* db/maint-missing-origin:
  Remove total confusion from git-fetch and git-push
  Give error when no remote is configured

Merge branch 'js/sideband-stderr'

* js/sideband-stderr:
  winansi: support ESC [ K (erase in line)
  recv_sideband: Bands #2 and #3 always go to stderr

Merge branch 'js/rsync-local'

* js/rsync-local:
  rsync transport: allow local paths, and fix tests

Merge branch 'rs/color-grep'

* rs/color-grep:
  grep: prefer builtin over external one when coloring results
  grep: cast printf %.*s "precision" argument explicitly to int
  grep: add support for coloring with external greps
  grep: color patterns in output
  grep: add pmatch and eflags arguments to match_one_pattern()
  grep: remove grep_opt argument from match_expr_eval()
  grep: micro-optimize hit collection for AND nodes

Merge branch 'js/remote-improvements'

* js/remote-improvements: (23 commits)
  builtin-remote.c: no "commented out" code, please
  builtin-remote: new show output style for push refspecs
  builtin-remote: new show output style
  remote: make guess_remote_head() use exact HEAD lookup if it is available
  builtin-remote: add set-head subcommand
  builtin-remote: teach show to display remote HEAD
  builtin-remote: fix two inconsistencies in the output of "show <remote>"
  builtin-remote: make get_remote_ref_states() always populate states.tracked
  builtin-remote: rename variables and eliminate redundant function call
  builtin-remote: remove unused code in get_ref_states
  builtin-remote: refactor duplicated cleanup code
  string-list: new for_each_string_list() function
  remote: make match_refs() not short-circuit
  remote: make match_refs() copy src ref before assigning to peer_ref
  remote: let guess_remote_head() optionally return all matches
  remote: make copy_ref() perform a deep copy
  remote: simplify guess_remote_head()
  move locate_head() to remote.c
  move duplicated ref_newer() to remote.c
  move duplicated get_local_heads() to remote.c
  ...

Conflicts:
builtin-clone.c

Merge branch 'tr/maint-1.6.0-send-email-irt'

* tr/maint-1.6.0-send-email-irt:
  send-email: test --no-thread --in-reply-to combination
  send-email: respect in-reply-to regardless of threading

Conflicts:
t/t9001-send-email.sh

Merge branch 'kb/checkout-optim'

* kb/checkout-optim:
  Revert "lstat_cache(): print a warning if doing ping-pong between cache types"
  checkout bugfix: use stat.mtime instead of stat.ctime in two places
  Makefile: Set compiler switch for USE_NSEC
  Create USE_ST_TIMESPEC and turn it on for Darwin
  Not all systems use st_[cm]tim field for ns resolution file timestamp
  Record ns-timestamps if possible, but do not use it without USE_NSEC
  write_index(): update index_state->timestamp after flushing to disk
  verify_uptodate(): add ce_uptodate(ce) test
  make USE_NSEC work as expected
  fix compile error when USE_NSEC is defined
  check_updates(): effective removal of cache entries marked CE_REMOVE
  lstat_cache(): print a warning if doing ping-pong between cache types
  show_patch_diff(): remove a call to fstat()
  write_entry(): use fstat() instead of lstat() when file is open
  write_entry(): cleanup of some duplicated code
  create_directories(): remove some memcpy() and strchr() calls
  unlink_entry(): introduce schedule_dir_for_removal()
  lstat_cache(): swap func(length, string) into func(string, length)
  lstat_cache(): generalise longest_match_lstat_cache()
  lstat_cache(): small cleanup and optimisation

grep: prefer builtin over external one when coloring results

As far as I know, not all grep programs support coloring, so we should
rely on builtin grep. If you want external grep, set
color.grep.external to empty string.

Signed-off-by: Nguyễn Thái Ngọc Duy <pclouds@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

config.txt: Describe special 'none' handling in core.gitProxy.

Signed-off-by: Emil Sit <sit@emilsit.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

ls-files: require worktree when --deleted is given

The code will end up calling lstat() to check whether the
file still exists; obviously this doesn't work if we're not
in the worktree.

Signed-off-by: Jeff King <peff@peff.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

git-branch.txt: document -f correctly

'git branch -f a b' resets a to b when a exists, rather then deleting a.
Say so in the documentation.

Signed-off-by: Michael J Gruber <git@drmicha.warpmail.net>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

pickaxe: count regex matches only once

When --pickaxe-regex is used, forward past the end of matches instead of
advancing to the byte after their start.  This way matches count only
once, even if the regular expression matches their tail -- like in the
fixed-string fork of the code.

E.g.: /.*/ used to count the number of bytes instead of the number of
lines.  /aa/ resulted in a count of two in "aaa" instead of one.

Also document the fact that regexec() needs a NUL-terminated string as
its second argument by adding an assert().

Signed-off-by: Rene Scharfe <rene.scharfe@lsrfire.ath.cx>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

git-send-email.txt: describe --compose better

Signed-off-by: Stephen Boyd <bebarino@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Tests: use test_cmp instead of diff where possible

Several old tests were written before test_cmp was introduced, convert
these to test_cmp.

If were are at it, fix the order of the arguments where necessary to
make expected come first, so the command shows how the test result
deviates from the correct output.

Signed-off-by: Miklos Vajna <vmiklos@frugalware.org>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Documentation: remove extra quoting/emphasis around literal texts

If literal text (asciidoc `...`) can be rendered in a differently from
normal text for each output format (man, HTML), then we do not need
extra quotes or other wrapping around inline literal text segments.

config.txt

  Change '`...`' to `...`. In asciidoc, the single quotes provide
  emphasis, literal text should be distintive enough.

  Change "`...`" to `...`. These double quotes do not work if present
  in the described config value, so drop them.

git-checkout.txt

  Change "`...`" to `...` or `"..."`. All instances are command line
  argument examples. One "`-`" becomes `-`. Two others are involve
  curly braces, so move the double quotes inside the literal region to
  indicate that they might need to be quoted on the command line of
  certain shells (tcsh).

git-merge.txt

  Change "`...`" to `...`. All instances are used to describe merge
  conflict markers. The quotes should are not important.

git-rev-parse.txt

  Change "`...`" to `...`. All instances are around command line
  arguments where no in-shell quoting should be necessary.

gitcli.txt

  Change `"..."` to `...`. All instances are around command line
  examples or single command arguments. They do not semanticly belong
  inside the literal text, and they are not needed outside it.

glossary-content.txt
user-manual.txt

  Change "`...`" to `...`. All instances were around command lines.

Signed-off-by: Chris Johnsen <chris_johnsen@pobox.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

git-push.txt: describe how to default to pushing only current branch

Signed-off-by: Chris Johnsen <chris_johnsen@pobox.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

disable post-checkout test on Cygwin

It is broken because of the tricks we have to play with
lstat to get the bearable perfomance out of the call.
Sadly, it disables access to Cygwin's executable attribute,
which Windows filesystems do not have at all.

Signed-off-by: Alex Riesen <raa.lkml@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Revert "lstat_cache(): print a warning if doing ping-pong between cache types"

This reverts commit 7734f04873cfaddd0b148074a633f1f824fd961f.

I guess that the reverted commit, 7734f048, has been in test long
enough, and should now be reverted.  I have not received any info
regarding any debug output of the reverted commit, so lets hope that
the lstat_cache() function do not cause any ping-pong.

Signed-off-by: Kjetil Barvik <barvik@broadpark.no>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

config: test for --replace-all with one argument and fix documentation.

Option --replace-all only allows at least two arguments, so
documentation was needing to be updated accordingly. A test showing
that the command fails with only one parameter is also provided.

Signed-off-by: Carlos Rica <jasampler@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

MinGW: a hardlink implementation

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

MinGW: a helper function that translates Win32 API error codes

This function translates many possible Win32 error codes to suitable
errno numbers.  We will use it in our wrapper functions that need to call
into Win32.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Remove total confusion from git-fetch and git-push

The config file is not the only place remotes are defined, and without
consulting .git/remotes and .git/branches, you won't know if "origin" is
configured by the user.  Don't give up too early and insult the user with
a wisecrack "Where do you want to fetch from today?"

The only thing the previous patch seems to want to prevent from happening
is a lazy "git fetch/push" that does not say where-from/to to produce an
error message 'origin not found', and we can do that by not letting
add_url_alias() to turn a nickname "origin" literally into a pathname
"origin" without changing the rest of the logic.

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Fix various dead stores found by the clang static analyzer

http-push.c::finish_request():
  request is initialized by the for loop

index-pack.c::free_base_data():
  b is initialized by the for loop

merge-recursive.c::process_renames():
  move compare to narrower scope, and remove unused assignments to it
  remove unused variable renames2

xdiff/xdiffi.c::xdl_recs_cmp():
  remove unused variable ec

xdiff/xemit.c::xdl_emit_diff():
  xche is always overwritten

Signed-off-by: Benjamin Kramer <benny.kra@googlemail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Sync with GIT 1.6.2.1

GIT 1.6.2.1

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

checkout bugfix: use stat.mtime instead of stat.ctime in two places

Commit e1afca4fd "write_index(): update index_state->timestamp after
flushing to disk" on 2009-02-23 used stat.ctime to record the
timestamp of the index-file.  This is wrong, so fix this and use the
correct stat.mtime timestamp instead.

Commit 110c46a909 "Not all systems use st_[cm]tim field for ns
resolution file timestamp" on 2009-03-08, has a similar bug for the
builtin-fetch-pack.c file.

Signed-off-by: Kjetil Barvik <barvik@broadpark.no>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

test-lib: write test results to test-results/<basename>-<pid>

The earlier code meant to attempt to strip everything except the test
number, but only stripped the part starting with the last dash.

However, there is no reason why we should not use the whole basename.

Signed-off-by: Johannes Schindelin <johannes.schindelin@gmx.de>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Remove unused assignments

These variables were always overwritten or the assigned
value was unused:

  builtin-diff-tree.c::cmd_diff_tree(): nr_sha1
  builtin-for-each-ref.c::opt_parse_sort(): sort_tail
  builtin-mailinfo.c::decode_header_bq(): in
  builtin-shortlog.c::insert_one_record(): len
  connect.c::git_connect(): path
  imap-send.c::v_issue_imap_cmd(): n
  pretty.c::pp_user_info(): filler
  remote::parse_refspec_internal(): llen

Signed-off-by: Benjamin Kramer <benny.kra@googlemail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

test-suite: Make test script numbers unique

In order to selectively skip tests, the environment variable GIT_SKIP_TESTS
can be set like this:

  $ GIT_SKIP_TESTS='t1301 t4150.18' make test

That is, its value can contain only the test script numbers, but not the
full script name. Therefore, it is important that the test scripts are
uniquely numbered. This makes it so.

Signed-off-by: Johannes Sixt <j6t@kdbg.org>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'maint'

* maint:

Merge branch 'maint-1.6.1' into maint

* maint-1.6.1:

Merge branch 'maint-1.6.0' into maint-1.6.1

* maint-1.6.0:
  bisect: fix another instance of eval'ed string
  bisect: fix quoting TRIED revs when "bad" commit is also "skip"ped
  Support "\" in non-wildcard exclusion entries

Conflicts:
git-bisect.sh

configure: rework pthread handling to allow for user defined flags

The tests for POSIX threads can now be controlled by the user with the
--enable-pthreads=FLAGS option.  If this is set (to some value other
than yes or no), the value is passed to the compiler.  Thread support
is based solely on the outcome of this test.  The user may specify not
to use threading at all or to use the default tests (first -pthread
then -lpthread) by not specifying FLAGS when passing --enable-pthreads.

Signed-off-by: Ben Walton <bwalton@artsci.utoronto.ca>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

configure: make iconv tests aware of user arguments

--with-iconv is now taken into account when doing the tests for iconv.
If the user requests alternate handling for libiconv, the -liconv test
is run before the -lc test.

Signed-off-by: Ben Walton <bwalton@artsci.utoronto.ca>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

configure: asciidoc version test cleanup

Redirect stderr to /dev/null instead of stdout.  This discards warnings
generated by python 2.6 related to the reorganization of functions within
modules.  The warnings were causing the version detection to break.

Signed-off-by: Ben Walton <bwalton@artsci.utoronto.ca>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

configure: wrap some library tests with GIT_STASH_FLAGS

Libraries that can have user specificed base paths are wrapped with
GIT_STASH_FLAGS/GIT_UNSTASH_FLAGS to ensure that the proper versions
on the system are tested.  This ensures, for example, that the zlib
tests for deflateUnbound are done with the version of zlib requested
by the user.  This is most useful in the absence of good settings for
CPPFLAGS and/or LDFLAGS.

Signed-off-by: Ben Walton <bwalton@artsci.utoronto.ca>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

configure: add macros to stash FLAG variables

Allow for quick stash/unstash of CPPFLAGS and LDFLAGS.  Library tests
can now be easily bracketted with these macros to allow for values
set in user/site arguments.

Signed-off-by: Ben Walton <bwalton@artsci.utoronto.ca>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

configure: reorganize flow of argument checks

Move the argument tests from the 'site overrides' so that they are
ahead of any library tests.  This allows for library tests to take
user specified paths into account.  The intent here is to avoid things
like NO_DEFLATE_BOUND being set due to finding old zlib when the user
has specified an alternate location for zlib.  (Ignore the fact that
properly set *FLAGS can avoid solve this issue.)

Signed-off-by: Ben Walton <bwalton@artsci.utoronto.ca>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

configure: ensure settings from user are also usable in the script

Allow things set by the user (--with-lib, --with-iconv, etc) to set
variables for use by other parts of the script.  Display values as
they're set.

Signed-off-by: Ben Walton <bwalton@artsci.utoronto.ca>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'en/maint-1.6.1-hash-object' into maint-1.6.1

* en/maint-1.6.1-hash-object:
  Ensure proper setup of git_dir for git-hash-object

Merge branch 'ks/maint-1.6.0-mailinfo-folded' into maint-1.6.0

* ks/maint-1.6.0-mailinfo-folded:
  mailinfo: tests for RFC2047 examples
  mailinfo: add explicit test for mails like '<a.u.thor@example.com> (A U Thor)'
  mailinfo: 'From:' header should be unfold as well
  mailinfo: correctly handle multiline 'Subject:' header

Merge branch 'cc/maint-1.6.0-bisect-fix' into maint-1.6.0

* cc/maint-1.6.0-bisect-fix:
  bisect: fix another instance of eval'ed string
  bisect: fix quoting TRIED revs when "bad" commit is also "skip"ped

Merge branch 'fg/maint-1.6.0-exclude-bq' into maint-1.6.0

* fg/maint-1.6.0-exclude-bq:
  Support "\" in non-wildcard exclusion entries

Merge branch 'js/maint-1.6.1-filter-branch-submodule' into maint-1.6.1

* js/maint-1.6.1-filter-branch-submodule:
  filter-branch: do not consider diverging submodules a 'dirty worktree'

Merge branch 'gt/maint-1.6.1-utf8-width' into maint-1.6.1

* gt/maint-1.6.1-utf8-width:
  builtin-blame.c: Use utf8_strwidth for author's names
  utf8: add utf8_strwidth()

Merge branch 'js/maint-1.6.1-remote-remove-mirror' into maint-1.6.1

* js/maint-1.6.1-remote-remove-mirror:
  builtin-remote: make rm operation safer in mirrored repository
  builtin-remote: make rm() use properly named variable to hold return value

Merge branch 'ek/maint-1.6.1-filter-branch-bare' into maint-1.6.1

* ek/maint-1.6.1-filter-branch-bare:
  filter-branch: Fix fatal error on bare repositories

Merge branch 'jc/maint-1.6.1-add-u-remove-conflicted' into maint-1.6.1

* jc/maint-1.6.1-add-u-remove-conflicted:
  add -u: do not fail to resolve a path as deleted

Merge branch 'js/maint-1.6.1-rebase-i-submodule' into maint-1.6.1

* js/maint-1.6.1-rebase-i-submodule:
  Fix submodule squashing into unrelated commit
  rebase -i squashes submodule changes into unrelated commit

Merge branch 'jc/maint-1.6.1-allow-uninteresting-missing' into maint-1.6.1

* jc/maint-1.6.1-allow-uninteresting-missing:
  revision traversal: allow UNINTERESTING objects to be missing

Merge branch 'ks/maint-1.6.0-mailinfo-folded' into maint-1.6.1

* ks/maint-1.6.0-mailinfo-folded:
  mailinfo: tests for RFC2047 examples
  mailinfo: add explicit test for mails like '<a.u.thor@example.com> (A U Thor)'
  mailinfo: 'From:' header should be unfold as well
  mailinfo: correctly handle multiline 'Subject:' header

Merge branch 'jk/maint-1.6.1-cleanup-after-exec-failure' into maint-1.6.1

* jk/maint-1.6.1-cleanup-after-exec-failure:
  git: use run_command() to execute dashed externals
  run_command(): help callers distinguish errors
  run_command(): handle missing command errors more gracefully
  git: s/run_command/run_builtin/

Merge branch 'jc/maint-1.6.0-split-diff-metainfo' into maint-1.6.0

* jc/maint-1.6.0-split-diff-metainfo:
  diff.c: output correct index lines for a split diff

read-tree A B C: do not create a bogus index and do not segfault

"git read-tree A B C..." without the "-m" (merge) option is a way to read
these trees on top of each other to get an overlay of them.

An ancient commit ee6566e (Rewrite read-tree, 2005-09-05) passed the
ADD_CACHE_SKIP_DFCHECK flag when calling add_index_entry() to add the
paths obtained from these trees to the index, but it is an incorrect use
of the flag.  The flag is meant to be used by callers who know the
addition of the entry does not introduce a D/F conflict to the index in
order to avoid the overhead of checking.

This bug resulted in a bogus index that records both "x" and "x/z" as a
blob after reading three trees that have paths ("x"), ("x", "y"), and
("x/z", "y") respectively.  34110cd (Make 'unpack_trees()' have a separate
source and destination index, 2008-03-06) refactored the callsites of
add_index_entry() incorrectly and added more codepaths that use this flag
when it shouldn't be used.

Also, 0190457 (Move 'unpack_trees()' over to 'traverse_trees()' interface,
2008-03-05) introduced a bug to call add_index_entry() for the tree that
does not have the path in it, passing NULL as a cache entry.  This caused
reading multiple trees, one of which has path "x" but another doesn't, to
segfault.

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Documentation: filter-branch: show --ignore-unmatch in main index-filter example

Rearrange the example usage of

  git filter-branch --index-filter 'git rm --cached ...'

so that --ignore-unmatch is in the main example block.  People keep
stumbling over the (lack of this) option to the point where it is a
FAQ, so we would want to expose the most common usage where it stands
out.

Signed-off-by: Thomas Rast <trast@student.ethz.ch>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

contrib/difftool: use a separate config namespace for difftool commands

Some users have different mergetool and difftool settings, so teach
difftool to read config vars from the difftool.* namespace.  This allows
having distinct configurations for the diff and merge scenarios.

We don't want to force existing users to set new values for no reason
so difftool falls back to existing mergetool config variables when the
difftool equivalents are not defined.

Signed-off-by: David Aguilar <davvid@gmail.com>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Update release notes to 1.6.3

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

send-email: test --no-thread --in-reply-to combination

3e0c4ff (send-email: respect in-reply-to regardless of threading,
2009-03-01) fixed the handling of the In-Reply-To header when both
--no-thread and --in-reply-to are in effect.  Add a test for it.

Signed-off-by: Thomas Rast <trast@student.ethz.ch>
Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'maint'

* maint:
  Update draft release notes for 1.6.2.1

Update draft release notes for 1.6.2.1

Signed-off-by: Junio C Hamano <gitster@pobox.com>

Merge branch 'js/maint-send-email' into maint

* js/maint-send-email:
  send-email: don't create temporary compose file until it is needed
  send-email: --suppress-cc improvements
  send-email: handle multiple Cc addresses when reading mbox message
  send-email: allow send-email to run outside a repo

Merge branch 'jk/sane-relative-time' into maint

* jk/sane-relative-time:
  never fallback relative times to absolute

Merge branch 'jc/maint-add-p-unquote' into maint

* jc/maint-add-p-unquote:
  git-add -i/-p: learn to unwrap C-quoted paths

Merge branch 'fg/maint-exclude-bq' into maint

* fg/maint-exclude-bq:
  Support "\" in non-wildcard exclusion entries

Merge branch 'en/maint-hash-object' into maint

* en/maint-hash-object:
  Ensure proper setup of git_dir for git-hash-object

Conflicts:
hash-object.c

Merge branch 'mg/maint-submodule-normalize-path'

* mg/maint-submodule-normalize-path:
  git submodule: Fix adding of submodules at paths with ./, .. and //
  git submodule: Add test cases for git submodule add

Merge branch 'jc/maint-1.6.0-keep-pack'

* jc/maint-1.6.0-keep-pack:
  is_kept_pack(): final clean-up
  Simplify is_kept_pack()
  Consolidate ignore_packed logic more
  has_sha1_kept_pack(): take "struct rev_info"
  has_sha1_pack(): refactor "pretend these packs do not exist" interface
  git-repack: resist stray environment variable

Merge branch 'rs/memmem'

* rs/memmem:
  optimize compat/ memmem()
  diffcore-pickaxe: use memmem()

Merge branch 'tv/rebase-stat'

* tv/rebase-stat:
  git-pull: Allow --stat and --no-stat to be used with --rebase
  git-rebase: Add --stat and --no-stat for producing diffstat on rebase

Merge branch 'jk/clone-post-checkout'

* jk/clone-post-checkout:
  clone: run post-checkout hook when checking out

Merge branch 'tr/format-patch-thread'

* tr/format-patch-thread:
  format-patch: support deep threading
  format-patch: thread as reply to cover letter even with in-reply-to
  format-patch: track several references
  format-patch: threading test reactivation

Conflicts:
builtin-log.c