Rewrite commands to use bugdirs instead of a single bugdir.

The bulk of the work is in regard to XML, with new BugDir.xml and
.from_xml methods to support the new <bugdir> entity.  I also split
the guts import_xml's ._run method into sub-methods to make the import
logic more obvious.

util:wsgi: add BEExceptionApp for translating storage exceptions.

This fixes .test_get_initial_value for the HTTP backend, because the
tests use TestingHTTP.getURL, which only catch HandlerError, not the
more specific storage exceptions.

bugdir: add `update` argument to BugDir.append().

This avoids a deepcopy error where the BugDir tries to update before
the Bug has had it's uuid assigned:

  Traceback (most recent call last):
    ...
    File ".../libbe/command/merge.py", line 168, in _run
      newCommTree = copy.deepcopy(bugB.comment_root)
    File "/usr/lib64/python2.7/copy.py", line 190, in deepcopy
      y = _reconstruct(x, rv, 1, memo)
    ...
    File "/usr/lib64/python2.7/copy.py", line 352, in _reconstruct
      y.append(item)
    File ".../libbe/bugdir.py", line 263, in append
      self._bug_map_gen()
    File ".../libbe/bugdir.py", line 152, in _bug_map_gen
      map[bug.uuid] = bug
  AttributeError: 'Bug' object has no attribute 'uuid'

bugdir: add BugDir.xml(), .from_xml(), and .append().

bug: fix invalid root element comment -> bug in Bug.from_xml().

bug: fix leading comment indentation in Bug.xml().

bug: add doctest for Bug.xml().

Allow symlinks in bugdir directories.

This allows you to do things like:

  $ mkdir -p /tmp/joint-repo/.be
  $ cd /tml/joint-repo/.be
  $ ln -s ~/src/be/.be/version
  $ ln -s ~/src/be/.be/bea86499-824e-4e77-b085-2d581fa9ccab/
  $ ln -s ~/src/BEurtle/.be/7017b289-f207-4e39-9746-f58323404eba/
  $ be list

without crashing with a:

  Traceback (most recent call last):
    File ".../libbe/storage/base.py", line 316, in children
      return self._children(*args, **kwargs)
    File ".../libbe/storage/vcs/base.py", line 820, in _children
      path = self.path(id, revision, relpath=False)
    File ".../libbe/storage/vcs/base.py", line 721, in path
      path = self._cached_path_id.path(id)
    File ".../libbe/storage/vcs/base.py", line 280, in path
      raise InvalidID(uuid)
  libbe.storage.base.InvalidID: 7017b289-f207-4e39-9746-f58323404eba in revision None

Currently it only lists the first bug directory it comes across, but
after this patch, it doesn't crash ;).

util:plugin: modnames() should only list *.py or *.pyc files.

By appending '.py' to *everything*, it was listing '__pycache__' for
Python 3.

gitignore: ignore autogenerated dist/.

gitignore: ignore autogenerated doc/libbe/.

libbe:util:wsgi: extract WSGI utilities into a separate module.

Convert my subscription email to tremily.

command:serve_commands: remove duplicate cruft and get working unit tests.

command:serve: add ability to pass raw POST data with getURL.

This is analagous to the earlier change to get_post_url:

  commit 0cd072b9710ee964e6f449abd9265d85e02f34d2
  Author: W. Trevor King <wking@tremily.us>
  Date:   Fri Aug 24 09:29:58 2012 -0400

    util:http: add ability to pass raw POST data with get_post_url.

command:serve_commands: new command for running a command server.

This is an initial step towards improving BE's efficiency.

Previously, BE gets slow as the bug count increases for several
commands (e.g. `be list`), because it takes time to load the bugdir
information from disk at each invocation.  If you use a remote repo
(`be --repo http://localhost:8000/ list`), the server process may have
already loaded the repo from disk, but now your listing process has to
fetch everything over the wire.  This is even worse than loading it
from disk.

With the new `be serve-commands` and `be --server URL ...` pair, the
bugdir loading happens once on the server, and all the processing is
also carried out on the server.  This means that calls like `be
--server http://localhost:8000/ list` will scale much better than
other methods.  For example:

  $ time be --server http://localhost:8000/ list > /dev/null

  real    0m2.234s
  user    0m0.548s
  sys     0m0.114s
  $ time be --server http://localhost:8000/ list > /dev/null

  real    0m0.730s
  user    0m0.548s
  sys     0m0.112s
  $ time be list > /dev/null

  real    0m2.453s
  user    0m2.289s
  sys     0m0.166s
  $ time be list > /dev/null

  real    0m2.521s
  user    0m2.350s
  sys     0m0.172s

The first call to a cold server takes about the same time as a local
call, because you need to load the bugs from the filesystem.  However,
later calls to a warm server are 3x faster, while later local calls
are still slow.

This is currently a minimal working implementation.  There's a good
deal of code in libbe.command.serve that I'd like to abstract out into
a libbe.util library (since there's still a bunch of duplication
between libbe.command.serve and libbe.command.serve_commands).  The
remote calls are also not as fast as I'd like, likely due to library
load times.  This commit just locks in an initial working
implementation.

command:base: only cleanup UseInterface.storage_callback if it's there.

It's hard to see why it wouldn't be, but .setup_command handles the
case where it's missing, so we should be consistent here.

command:base: use is/is-not None instead of ==/!= None in setup_command.

More Pythonic.

command:serve: wrap server in ExceptionApp regardless of SSL.

Previously, only the SSL server was using ExceptionApp.

util:http: add ability to pass raw POST data with get_post_url.

util:http: convert urllib2.URLError into HTTPError in get_post_url.

Also rework liburl2.HTTPError handling to get both the reason and the
error code into the HTTPError message.

util:http: pull HTTP helpers from libbe.storage.http into their own module.

This way they can be shared with the upcoming Command._run_remote.

storage:http: use an explicit relative import for base.

storage:http: adjust HTTPError message in get_post_url.

We'll usually get this message if we fail to reach the server, but we
can also get it if the server is so broken that it dies without
returning a valid HTTP response.

storage:http: add agent argument to get_post_url.

This allows us to set an appropriate user agent if we use this
function in other places (e.g. upcoming Command._run_remote).

command:serve: add SilentRequestHandler to avoid double-logging requests.

They were being logged by the request handler, and then logged again
by WSGI_Object.log_request.  After this patch, requests are only
logged when logger.level is at a <= level (e.g. closer to DEBUG)
than the WSGI_Object.log_level (usually INFO).  For example, in
Serve_setup_logging,

  self.logger.setLevel(logging.INFO)

will get request logs printed, but

  self.logger.setLevel(logging.WARNING)

will not.

libbe:util:plugin: cleanup recent zip/egg handling code.

To test this, you'll need to build an egg.  You can use setuptools to
do this, by applying:

<snip-patch>

Cherrypick improved zipfile support from Niall Douglas.

WTK: This is the meat of Niall's

  commit 4632cb6d22faa7220540f92af67693084f80f033
  Author: Niall Douglas ...
  Date:   Wed Feb 22 17:46:06 2012 +0000

    Fixed small bug where running from inside zip support was over
    preferring .pyc files

Cherrypick initial zipfile support from Niall Douglas.

WTK: This is a portion of Niall's

  commit 7f7a7738bcbcfd06a026f2985c1823a4ba5eb55b
  Author: Niall Douglas ...
  Date:   Tue Feb 21 20:35:28 2012 +0000

    Several hacks to make BE compatible with bbfreeze and therefore
    compilable into a self contained directory

storage:vcs:hg: remove grandchildren from Hg._vcs_listdir.

This fixes:

  From: Phil Schumm
  Date: Thu, 23 Aug 2012 08:15:21 -0500
  Subject: [Be-devel] -be diff- under Hg

  ...
  I've just noticed that -be diff- seems to yield different output
  under Git than it does under Hg (e.g., in a Mercurial +repository,
  -be diff- appears to show all changes as new bugs rather than
  modified).
  ...

storage:base: add tests to catch grandchildren in .children() output.

With a tree like:

  a
  `-- b
      `-- c

children(a) should return [b], not [b, c] or [c].  This catches a bug
in the Mercurial backend.  Fix to follow.

storage:vcs:hg: fix missformed file_a -> file_b message typo.

Update CherryPy dependency package to python-cherrypy3 on Debian.

Thanks to Tim Mazid for reporting the bug, and Israel Basurto for
suggesting the fix.

On Wed, May 09, 2012 at 07:26:14PM +1000, Tim Mazid wrote:
> $ interfaces/web/cfbe.py ~/projects/proj/
> Bugs Everywhere Directory v1.4
> Traceback (most recent call last):
>   File "interfaces/web/cfbe.py", line 42, in <module>
>     cherrypy.quickstart(WebInterface, '/', app_config)
> AttributeError: 'module' object has no attribute 'quickstart'
>
> This is with the latest be from git, and python-cherrypy 2.3.0-3 from
> Debian wheezy.

Fix deb-python -> dev-python typo in doc/install.txt.

Change my email address from drexel.edu to tremily.us.

Normalize whitespace in interfaces/web/webpy.

Normalize whitespace in interfaces/web/templates/base.html.

Add tag filter on the web interface

Apply Niall's earlier fix for comment XML loading to bug XML loading.

Sometimes saxutils returns unicode.

Make ID expansion less strict for comment text.

This avoids errors if the comment text references a repository that
you don't have locally.

Fix `be import_xml` bugs.

Make the full UUIDs optional for `new` and `comment`.

This makes the default output less threatening for new users, while
still supplying the full UUIDs for driving BE from external software.

Print full UUIDs during `new` and `comment`.

Added BE_INPUT_ENCODING and BE_OUTPUT_ENCODING to allow charset for stdin and stdout to be overridden. This is necessary on Windows as there is no way for external programs to set stdin or stdout charsets :(

Oops, forgot to bump the version and date when tweaking the man page.

Use a bare URL for the link from the man page to online docs.

This will make it easier (possible?) for people using the roff version
of the man page to follow the link.

Use $ instead of % for the prompt in the man page bug submission example.

I changed my mind and fixed #/03d07e61#.

Keep stdin (file descriptor 0) open in the pager's child process.

This fixes the underlying problem that we worked around in commit
2c9ae15f53aef57d28091b237c193c653c6e80dd.  Now even

  $ echo 'some bug | be --paginate new -

will work instead of raising IOError: [Errno 9] Bad file descriptor.

Add `new` to list of commands that should not default to using the pager.

If the command is run in the pager, access to stdin is tricky, so I
avoid it by default.  I'd just missed the fact that `new -` used
stdin, which caused

  https://bugzilla.redhat.com/show_bug.cgi?id=751473

  $ be new -
  Traceback (most recent call last):
    ...
    File "/usr/lib/python2.7/site-packages/libbe/command/new.py", line 89, in _run
      summary = self.stdin.readline()
    ...
    File "/usr/lib64/python2.7/codecs.py", line 473, in read
      newdata = self.stream.read(size)
  IOError: [Errno 9] Bad file descriptor

Hide the traceback on InvalidURL errors.

In response to

  https://bugzilla.redhat.com/show_bug.cgi?id=733945

in which Neal Becker was bummed at the long traceback, which may
initially look like a programming issue.

Remove util.subproc.Pipe, as we no longer use it in BE.

This was at one point used by `update_copyright.py`.  Now that that is
an external package (and doesn't use `Pipe` anymore either), we can
safely remove this code.

As a side benifit, the Pipe doctests will no longer be there to fail
on OS X and other systems sufficiently different from my development
box.

Add CherryPy dependency and minimal install info to doc/install.txt.

I seem to have left CherryPy out of the earlier list.

The extra handholding for minimal installations is an attempt to
address problems people have had installing BE on non-Linux systems,
where the standard build tools are less common.

I also mention my Gentoo overlay and Michel Alexandre Salim's Fedora
package, so people running Gentoo and Fedora don't have to bother
figuring any of this out ;).

Finally, I moved the package information up to the top of the install
page, so people on supported systems realize they have an easy out
before reading through the install procedure.

Cherrypick a better version string for setup.py from Niall Douglas.

WTK: This is a small part of Niall's

  commit 7f7a7738bcbcfd06a026f2985c1823a4ba5eb55b
  Author: Niall Douglas ...
  Date:   Tue Feb 21 20:35:28 2012 +0000

    Several hacks to make BE compatible with bbfreeze and therefore
    compilable into a self contained directory

I cleaned up his string construction, which was originally

  version.version()+" ("+rev_date+")"

Avoid generating another StringIO instance in StringInputOutput.get_stdout().

Shuffle doc/conf.py to get the Git revision into the Sphinx documentation.

Update update-copyright to version 0.3.

Add update-copyright as a submodule and update release.py accordingly.

Also add `**kwargs` to `invoke` so we can specify the environment.

Fix release.py to allow uncommented initial _VERSION.

I was in favor of always leaving _VERSION commented in the trunk,
since released branches should fork off the trunk:

  trunkA -> trunkB -> trunkC -> trunkD
   `-> 1.0.0           `-> 1.1.0
        `-> 1.0.1           `-> 1.1.1

But that doesn't seem to have been how things have worked out in BE.
In any case, you will need to release on top of a previous release
(e.g. 1.0.1 on top of 1.0.0 in my above example), so we cannot depend
on an initial comment character before _VERSION.

Modify release.py for external update-copyright.py.

Ran update-copyright.py.

Transition to my external update-copyright package.

http://pypi.python.org/pypi/update-copyright/

Add .mailmap, mapping Git committers and authors to canonical names.

Generated libbe/_version.py was not UTF-8 aware.

So make failed for me (Matěj Cepl).

Signed-off-by: Matěj Cepl <mcepl@redhat.com>

Fix .gitignore

Per gitignore(5) it seems to me that directories in the root of the
repository should be ignored without leading ./ files. E.g.

build/

is correct for ignoring build/ directory and its content.

Signed-off-by: Matěj Cepl <mcepl@redhat.com>

Merge www.physics.drexel.edu/~wking/code/git/be

Fix up broken merge commit.

Fix my busted 1512c0e2a64e patch to libbe/util/encoding.py.

Some temporary changes to encoding.py seem to have been added to
  commit 1512c0e2a64e19c8d4e5697257a4df5ddd8bc727
  Author: W. Trevor King <wking@drexel.edu>
  Date:   Tue Nov 8 07:14:43 2011 -0500
by accident.

The initial change came from discussions with Niall Douglas, during
which I realized that "filesystem encoding" ususally means the
encoding for the *path*, not the *contents*.  To avoid further
confusion I'd renamed `get_filesystem_encoding` to the less ambiguous
`get_text_file_encoding`.  This commit should complete the transition.

Ran update_copyright.py.

Mention `~/.local/bin/` when using default `--user` install.

Correct doc/install.txt to refer to INSTALL_OPTIONS instead of PREFIX.

This catches the docs up with the changes made in:
  commit a7ad89a6ad7da55089e6f9a4cdd645b7079ee04e
  Author: W. Trevor King <wking@drexel.edu>
  Date:   Sat Apr 16 21:26:02 2011 -0400

Add the BE_ENCODING environmental variable to override the default encoding.

Adjust encoding detection (using sys.getfilesystemencoding for file contents).

Won't fix #/03d07e61# (bad permission crash).

Fixed #/bc1e6ff4# (extra argument crash).

Oops, that forgot the equals part of Mercurial 1.9 or greater.

Merge remote branch 'tanguy/master'

Adjust Mercurial execution so it works with version 1.9 and earlier.

This makes the changes for 1.9 brought in by
  bb645f8e489b9f50cd0aec7237ec9adb721797a8
optional.  If the Mercurial version is 1.9 or greater, the new code is
used.  Otherwise, the old code is used.

Move Bzr.version_cmp to VCS.version_cmp.

The version comparison code will be useful for all VCSs.

Merge remote branch 'pschumms/master'

Add Jinja to the dependency documentation.

Remove redundant re import from previous bzr version_cmp patch.

Enhance Bzr.version_cmp to handle non-numeric versions

bzr uses non-numeric tags to indicate prereleases; previously, this
triggers an exception in be's Bzr module as version comparison is only
supported between version strings that only contain numbers and dots.

This patch extends version_cmp to support a single non-numeric
pre-release string of arbitrary length (e.g. 'a', 'b', 'pre', 'rc'), and
extends the docstring tests to cover this extension.

Signed-off-by: Michel Alexandre Salim <salimma@fedoraproject.org>

Minor fix to doctest for command.base.get_command(); failure introduced by change to command.base.UnknownCommand in commit 0d5c9c68e947617c9d073d5f19351bdd8f3866db

Add ImportError to UnknownCommand output in get_command doctest.

This catches the test result up after:

  Commit: 0d5c9c68e947617c9d073d5f19351bdd8f3866db
  Author: W. Trevor King <wking@drexel.edu>
  Date:   Wed May 25 10:30:19 2011 -0400

    Attach ImportError message to UnknownCommand to aid debugging.

bugseverywhere.org has changed URL handling, so use different URLs for HTTP testing.

Fixed problem with Hg support under version 1.9 (mercurial.dispatch.dispatch() now takes a single request object with option for capturing output stream)

Report bug: crash on permission problems

Report bug in arguments processing

Raise UserError if summary is not given to `be commit`.

If the user doesn't provide the summary on the command line, through
stdin, or through editor_string, raise an error.  This will generally
happen with

  $ be commit
  (user doesn't enter any text in the editory)

Attach ImportError message to UnknownCommand to aid debugging.

Add 'Power features' page to the docs.

Rework summary handling in `be commit`.

Now you can run `be commit` with no options and have the summary split
off the body automatically.  This should be more familiar to most VCS
users.

Run update_copyright.py.

Move Tim Guirgies' help for status/severity overrides to .

Remove "be set" reference in favour of actual help

Because "be set severity blah" does not actually work, referring users
there to set custom severity levels is just cruel (I spent a half hour
trying to figure out what I was doing wrong). Thus, it is much easier
to, at least for now, state in the help message what they must do in
order to get custom severities and statuses.

Teach be status --help to load per tree config

Again, there is discrepancy between severity.py and status.py. I thought
this feature was extremely useful in severity.py and it should be put
into status.py too.

Restructure severity help function to match status

The code structure was vastly different in severity.py to status.py, so
I mostly copied the structure from there and adjusted it to suit
severity.

The structure in status.py looked (to me) cleaner, more organised, and
easier to work with.

Also, users are now referred by "be severity --help" to "be set --help",
in a manner similar to "be status --help".
For those that don't know that severity can be adjusted on a per
repository basis, this seems extremely helpful. A similar message
appears for status, but not here.

Use open() instead of file() in CachedPathID doctests (2to3 compatability).

Remove form feeds (for compatibility with 2to3).