Add jodata-convert-1.1 symlink and fix GitHub tarball unpacking.

Packaged dev-java/joda-convert (a dependency of dev-java/jodata-convert-2.0.

Quote '' in dev-java/fits ebuild.

Build classpaths required by dev-java/fits' javadoc target.

Use EANT_GENTOO_CLASSPATH to avoid a call `java-pkg_getjar` in dev-java/fits.

That's what EANT_GETNTOO_CLASSPATH is for, and having a calling a
function (such as `java-pkg_getjar`) outside any of the src_*()
wrappers is not a good idea.

Also:
* Save the download as `${P}-src.jar` instead of `${P}_src.jar`.
* Fix the `java-pkg_newjar` calling syntax (I'd swapped the order).

Assorted, minor dev-java/fits cleanups

* Strip trailing whitespace from files/build.xml
* Place the built jar in build/ rather than in the base directory.
* Use ant's `-D=property=value` option to alter the project version
  and junit JAR path, rather than sedding build.xml
* Use `${doc.api}` instead of repeathing `${doc}/api` in build.xml.

Mention the two new dev-java/fits patches in the fits ChangeLog.

Add two dev-java/fits patches and cleanup so tests all pass.

Add dev-java/fits packaging nom.tam.fits.

Add ~amd64 keyword to sawsim ebuild (I've tested it on a 64-bit Clovertown E5320).

Add sci-libs/pyafm dependency to calibcant.

Add django-grappelli package.

There's already an ebuild in the piczu overlay, but it's based on the
old Subversion/Google Code repository.  Grappelli has since moved to
Git/Github.

Add django-positions package.

django-taggit is actually distributed under the 3-clause BSD license.

Add django-taggit package.

Add python[sqlite] use dependency to timebook.

Add timebook package.

Version bump to track Portage-trunk's mutt.

Convert pypiezo dependencies from pyyaml+h5py to h5config.

Add curses-check-for-keypress dependency to pypiezo.

Oops.  Cleanup h5config's IUSE (sloppy copy from pypid).

Add h5config package.

Remove a number of http:// typos in assorted ebuilds.

Add serial (pypid and pymodbus) and modbus (pypid) USE flags.

Add pypid package.

Use EAPI 3 in aubio ebuild to be unpacker-agnostic.

Oops.  Update aubio digest after tweaking keywords.

Restrict the development build of aubio to systems I've tested it on.

Add git-based aubio package (unreleased Python 2.7 fixes in the trunk).

Add django-tables2 package.

pymodbus doesn't need to depend on pyserial directly (twisted dependency).

Oops, [R]DEPENDS -> [R]DEPEND in pymodbus ebuild.

Add full dependency atoms and pyserial dependency for pymodbus.

Add pymodbus package.

Inherit eutils (for epatch) in lifelines ebuild.

Add divorce patch to lifelines.

Add mutt package incorperating pgp_verbose_mime patch.

Add virtual monkeysphere-validation-agent package.

Add msva-perl package.

Also give monkeysphere group rwx permissions on /var/lib/monkeysphere.

Add elog discussing monkeysphere group.

Rework /var/lib/monkeysphere creation so it is owned by monkeysphere:monkeysphere (not monkeysphere:root).

enewuser/enewgroup in monkeysphere ebuild.

Correct dev-tex -> virtual in thesis-tools ChangeLog.

Correct be -> monkeysphere in monkeysphere ChangeLog.

Add Crypt-X509 package (generated with g-cpan).

This is a dependency for msva-perl.

Fix monkeywphere -> monkeysphere typo in ChangeLog.

Add monkeysphere package.

Add bash-completion USE flag to be.

Add SUPPORT_PYTHON_ABIS and RESTRICT_PYTHON_ABIS to geopy ebuild.

Add geopy package.

Update FFT-tools license to GPLv3+.

Add mxconns package.

Add jinja dependency to BE ebuild.

Update comedilib/demo/Makefile patch.

Adjust source directory for non-git obexpushd (e.g. obexpushd-0.11.2.ebuild).

obexpushd currently requires bluez/bluetooth.

Add app-mobilephone/opexpushd package.

Bump itex2mml to 9999 (build from Bazaar repository).

Add itex2mml-1.3.5.ebuild from Gentoo bug 194499.

thesis-tools now required the latex USE flag for asymptote.

Calibcant doesn't actually use the X flag.

Add sci-physics/calibcant package.

Add H5Py and PyYAML dependencies for pypiezo.

Add sci-libs/pyafm package.

Pycomedi depends on sci-libs/comedilib, not sci-misc/comedilib.

Add sci-libs/pypiezo package.

Move pycomedi from dev-python to sci-libs.

Add dev-python/pycomedi package.

Add sci-libs/stepper package.

Fix FFT-tools DESCRIPTION.

Fix ${P} -> ${PN} in sawsim's EGIT_REPO_URI.

Oops, update comedi-headers/Manifest after changing ChangeLog.

Override RUBYOPT when configuring Comedilib ruby binding installation.

With an unmasked RUBYOPT="-rauto_gem" [1] the .config file ignores the
DESTDIR environmental variable, for reasons I have not isolated.  This
leads to sandbox violations during `ruby setup.rb install` when the
ebuild tries to install directly to
/usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/comedi.rb rather than
${D}/usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/comedi.rb.

error message:
   * Call stack:
   *     ebuild.sh, line  56:  Called src_install
   *   environment, line 5179:  Called die
   * The specific snippet of code:
   *           ruby setup.rb install || die "ruby setup.rb install failed";

chmod sandbox violation:
  F: chmod
  S: deny
  P: /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/comedi.rb
  A: /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/comedi.rb
  R: /usr/lib/ruby/site_ruby/1.8/comedi.rb
  C: ruby setup.rb install
and an identical violation with `F: open_wr`.

[1] Set by dev-ruby/rubygems via /etc/env.d/10rubygems.

Update Comedi related ebuilds now that upstream moved from CVS to Git.

Add curses-check-for-keypress ebuild.

Add PyYAML depedency to Hooke ebuild.

Updated be ebuild for rst2man man page generation.

Update comedilib's econf call to use EPREFIX and fix localstatedir.

Fix or cleanup URLs in sawsim ebuild.

Add FFT-tools ebuild.

Add udev rules to assign /dev/comedi* to the comedi group.

Sample .abc files have been moved in recent abcmidi tarballs.

Bump abcmidi to 2011.01.01 and fix 9999->2010.09.28 in its ChangeLog.

Remove comedilib-9999-comedi.i.patch.

Changes accepted upstream:

revision 1.13
date: 2010-12-20 09:50:21 -0500;
author: abbotti;
state: Exp;
lines: +16 -2;
commitid: bYxCcTeCEsZcX11v;

Add sampl_t and lsampl_t array_class()es to comedi.i.

This makes it easier (possible?) to setup comedi_insn_struct and
comedi_cmd_struct instances.

Patch from W. Trevor King.

Update to EAPI 3 and fix several repoman issues.

I believe the remaining repoman issues are due to:

* some dependency packages in overlays (vs. the main Portage tree)
* some packages only supporting version controlled source (makes it
  hard to depend on a specific version)

Neither one of these will cause me to loose sleep ;).

Add sampl_t and lsaml_t array_class()es to comedi.i.

Final comedilib setup.py patch accepted upstream.

revision 1.3
date: 2010-12-17 08:56:26 -0500;
author: abbotti;
state: Exp;
lines: +1 -1;
commitid: 7KcV6XG9dDCVKD0v;

Adjust setup.py to link against libtool's lib/.libs/.
Patch from W. Trevor King.

Adapt to upsteam's partial acceptance of the comedilib setup.py patch.

Comedilib comedilib.pc.in and setup.rb patches merged upstream.

$ cvs log comedilib.pc.in
...
revision 1.2
date: 2010-12-14 09:41:55 -0500;
author: abbotti;
state: Exp;
lines: +1 -1;
commitid: JoFyUjr1kr0t6g0v;

Add -lm to comedilib.pc.in Libs.
Patch from W. Trevor King.
...

$ cvs log swig/ruby/setup.rb
...
revision 1.3
date: 2010-12-14 09:37:18 -0500;
author: abbotti;
state: Exp;
lines: +3 -0;
commitid: 2pQqTp57JCuS4g0v;

Import DESTDIR in swig/ruby/setup.rb for configurable rbconfig install paths.
Patch from W. Trevor King.
...

Fix comedilib.pc.in and use pkg-config in the demo/Makefile patch.

Patch comedilib demo/Makefile so it successfully compiles after installation.

Install demo/.deps in comedilib-9999.ebuild.

Use pushd/popd instead of repeated `cd X/cd "${S}"` calls in comedilib-9999.ebuild.

This removes the assumption that the build process was in ${S} at the
beginning of the block.  It also fixes problems with glob expansion as
explained below:

From the Pathname Expansion section of bash(1), pathname expansion
happens after word splitting, and therefore before variable expansion.
A simple example of this is
  tmp $ echo "${PWD}/*"
  /tmp/*
when I had originally expected the same output as
  pushd /tmp/; echo *; popd
  /tmp /tmp
  file1 file2 file3 ...
  /tmp

Adjust comedilib-9999-setup.py.patch to link against libtool's lib/.libs/

Fix ruby installation in comedilib-9999.ebuild.

Also:
* Move assorted /usr/share/doc/${PF}/*.conf into /usr/share/doc/${PF}/etc/
* Remove /usr/share/doc/${PF}/ if the doc USE flag is not set
* Only run distutils_pkg_postinst if the python USE flag is set

Correct PYTHON_MODNAME (add .py) in comedilib-9999.ebuild.

Cleanup doc demo installation for comedilib-9999.ebuild.

The previous implementation installed compiled object and binary files
as well as the demo source.  There's a Makefile handy, so people can
easily compile the demo programs on their own if they want.

Fix python installation in comedilib-9999.ebuild.

Also:
* Install demo code when `doc` USE flag is set.
* Don't install comedi_calibrate man page, since we don't install a
  comedi_calibrate binary.

Bump to sci-libs/comedilib-9999 and add sci-misc/comedi-headers-9999.

The tricky part is handling /usr/include/comedi.h, which is supplied
by:

* the kernel's staging comedi drivers (but not installed)
    drivers/staging/comedi/comedi.h
* the Comedi module (installed via sci-misc/comedi-headers):
    include/linux/comedi.h
* the Comedilib module (not installed)
    include/comedi.h

The current CSV sources are very similar, but there are reasonable
differences with the staging version.  Hopefully everything works out
;).

The dependency setup is based on media-libs/alsa-lib and
media-sound/alsa-headers, which have to deal with a similar setup (in
kernal driver, out of kernal driver, and userspace library).