PreservedLibsRegistry: try to parse as JSON first

PreservedLibsRegistry: enable JSON write support

JSON read support has been available since portage-2.2.0_alpha89.

getmaskingreason: use remember_source_file

This will fix bug #409179.

Bug #361759: QA check for /etc/udev/rules.d

Map emerge --buildpkg=n to FEATURES=-buildpkg.

This will fix bug #409085.

doebuild_environment: comment on bug #408817

spawn_nofetch: clone locked config, bug #408817

It's unsafe to pass in an unlocked config instance, since that can
trigger issues like bug #408817 due to fragile assumptions involving
the config state inside doebuild_environment().

Revert "depgraph: reset pkgsettings after setcpv"

This reverts commit 884993c7f4b9e7e9ede690f5fab81742915fc942.
Calling reset is expensive and is not really needed since commit
3ca5f0cc08d233a3e229e78b573c7aab7d46cb9c.

doebuild_environment: sanity check for bug 408817

Ensure that CATEGORY is determined correctly, and raise AssertionError
if it can't be determined.

depgraph: reset pkgsettings after setcpv

This should prevent doebuild_environment from incorrectly using the
CATEGORY from the previous setcpv call, as reported in bug #408817.

unmerge: remove unused preserve-libs

This fixes a case were one or more packages are unmerged without being
replaced, and some preserved libraries need to be removed because
they all consumers have just been unmerged.

dispatch_conf: fix broken diffstatusoutput_len

etc-update: quote ${file}

etc-update: ignore non-existent CONFIG_PROTECT

Omit EPREFIX from paths in unicode QA Notice.

Use eqawarn for install of non UTF-8 file names.

This will fix bug #406749.

repoman: add --digest=<y|n> option, bug #406875

repoman: ignore temp files, bug #406877

If the file isn't in the VCS new or changed set, then assume that
it's an irrelevant temporary file. This relies on commit
2dac56fa282645031eb29860abc403e983a04b2d to guarantee that Manifest
entries are not generated for file names containing prohibited
characters.

Manifest: filter file names with repoman's regex

This makes Manifest generation consistent with repoman, which is
necessary if repoman is going to ignore irrelevant files as requested
in bug #406877.

Add a Makefile derived from the portage ebuild.

This will fix bug #335320.

Display: spawn pkg_nofetch when appropriate

Signed-off-by: Zac Medico <zmedico@gentoo.org>

QA: detect pkg-config files that bleed LDFLAGS

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

etc-update: ignore changes in whitespace (-b) for automerge

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

portageq: add "colormap" helper

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

etc-update: fix logic bug with protected files

The rewrite introduced a slight bug with protected files.  Fix that,
and rework the code slightly to make it obvious that we want a diff
set of options for files and dirs.

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

etc-update: handle symlinked files

If the config file is symlinked somewhere, then update the target rather
then discarding the symlink and replacing it with a real file.

URL: http://bugs.gentoo.org/330221
Reported-by: Jack Byer <ftn768@gmail.com>
Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

etc-update: fix default "enter" behavior

Adding support for -[3579] command line flags inadvertently broke the
default behavior of hitting "enter" to automatically select the next
file.  Make this work again.

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

etc-update: add a --preen flag

Add a flag to merge just trivial updates and then quit.

URL: http://bugs.gentoo.org/159080
Reported-by: Iván Pérez Domínguez <iperez@babel.ls.fi.upm.es>
Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

etc-update: support scan paths on the command line

URL: http://bugs.gentoo.org/59235
Reported-by: Cory Visi <merlin@gentoo.org>
Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

dispatch-conf: do regex matching ourselves

This avoids having to pipe through multiple greps, as well as running
diff multiple times on the same set of files.

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

ebuild.sh: skip EBUILD_HOOK_DIR for depend phase

install-info: avoid unnecessary shell

Exit after killed while waiting on prefetch.

Use Popen to avoid unnecessary shell.

Disable 'illegally inherited' check for nofetch.

It's disabled for nofetch, since that can be called by repoman and
that triggers bug #407449 due to repoman not exporting non-essential
variables such as INHERITED.

dispatch-conf: add --help/--version flags

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

etc-update(1): flesh out a bit more

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

etc-update: turn -[3579] flags into command line option

This lets people do `etc-update --automode -3` rather than having
to do something like `echo "-3" | etc-update`.

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

etc-update: rewrite significantly

This tool is very inefficient, especially in the case of auto-merging
with -3/-5 and such.  Rewrite the code to kill off dead paths, compress
multiple greps into a single sed, cache more calculated results, and
use bash code where possible rather than execing external tools.  There
are also style updates here, many of which fix quoting issues and other
such things.

The next rewrite should probably be in python, but this version is
fast enough for me now even on my slow machines.

Signed-off-by: Mike Frysinger <vapier@gentoo.org>

whirlpool.py: fix WhirlpoolAdd for bug #406407

This file is a python port of Whirlpool.c the reference implementation:

  http://www.larc.usp.br/~pbarreto/whirlpool.zip

Comparison of both implementations reveals a difference in loop logic
at the very beginning of the WhirlpoolAdd function, which is fixed now.

pruneNonExisting: handle eselect-opengl symlinks

Only count symlinks as preserved if they still point to a hardink
in the same directory, in order to handle cases where a tool such
as eselect-opengl has updated the symlink to point to a hardlink
in a different directory (see bug #406837). The unused hardlink is
automatically found by _find_unused_preserved_libs, since the soname
symlink no longer points to it. After the hardlink is removed by
_remove_preserved_libs, it calls pruneNonExisting which eliminates
the irrelevant symlink from the registry here.

repoman: say Git >=1.7.9 needed for signed commit

repoman: support overlays without repo_name

action_build: return 1 for "no" --ask answer

cvstree.getentries: handle "ignored" files in cvs

It's possible for files to be under version control even though they
match our ignore filter, so don't ignore them if they are listed in the
"Entries" file. Thanks to Mike Gilbert <floppym@gentoo.org> for
reporting in this blog post:

http://floppym.blogspot.com/2012/02/cvs-status-display-cvs-checkout-in-svn.html

autounmask: Avoid unmasking live versions if possible

Before this patch the allowed changes were:

1. USE
2. USE + ~arch + license
3. USE + ~arch + license + missing keywords + masks

With this patch:

1. USE
2. USE + ~arch + license
3. USE + ~arch + license + missing keywords
4. USE + ~arch + license + masks
5. USE + ~arch + license + missing keywords + masks

This avoids unmasking live versions, which are typically masked
and have missing keywords to be avoided if there is a regular
masked version available.

Reorganize how autounmask allows changes to be made

This patch does not change emerge's behaviour.

autounmask: Fix USE change messages to display the correct parent

Fixes bug 399863.

Unmerge orphan directory symlinks for bug 384397.

dblink: split out _unmerge_dirs method

This code will need to be called twice when safely unmerging symlinks
to directories (bug #384397).

ecompressdir: handle abs symlink, bug #405327

Scheduler: hang in _schedule_tasks, bug 404995

This is triggered whenever emerge bails out while parallel-fetch is
running in the background.

_eventloop: use explicit relative imports

MtimeDB: add JSON read/write

Support serialization as JSON instead of pickle, so that
/var/cache/edb/mtimedb is human readable/writable, for those rare
cases where it may be useful. Currently, pickle is still used for
writes. The plan is to migrate to JSON after JSON read has been
supported for some time.

MtimeDB._load: explicitly close file

PreservedLibsRegistry: add JSON read/write

Support serialization as JSON instead of pickle, so that
/var/lib/portage/preserved_libs_registry is human readable/writable,
for those rare cases where it may be useful. Currently, pickle is still
used for writes. The plan is to migrate to JSON after JSON read has
been supported for some time.

repoman: make virtual.oldstyle an error

Also, add "allow-provide-virtuals = true" setting for
metadata/layout.conf which reduces it to a warning.

portage.5: layout.conf manifest-hashes example

PollSelectAdapter: don't inherit PollConstants

Move Poll{Constants,SelectAdapter} to _eventloop.

Move _emerge.SlotObject to portage.util.

SlotObject: validate __slots__ and keyword args

Remove redundant inherited __slots__ values.

EventLoop: fix _io_handler_class "f" attribute

portage.package.ebuild.fetch.fetch(): Fix ResourceWarning with Python 3.2.

EventLoop.iteration: run timeouts last

Run timeouts last, in order to minimize latency in termination of
iteration loops that they may control.

SubProcess._waitpid_cb: fix args for glib compat

EventLoop: prune obsolete code

EventLoop.iteration: poll for blocking, not sleep

The effect is be mostly the same, but it's more conistent to use
_do_poll for all blocking, plus it has EINTR handling.

EventLoop.child_watch_add: dynamic IO watch

The IO watch is dynamically registered and unregistered as needed,
since we don't want to consider it as a valid source of events when
there are no child listeners. It's important to distinguish when there
are no valid sources of IO events, in order to avoid an endless poll
call if there's no timeout. This fixes possbible endless poll calls
since commit 1979a6cdfcd8c6bae4565982d82d862be07ba5be.

EventLoop: wakeup poll loop to receive sigchild

TODO: Find out why SIGCHLD signals aren't delivered during poll calls,
forcing us to wakeup in order to receive them. This fixes random hangs
in poll calls since commit 1979a6cdfcd8c6bae4565982d82d862be07ba5be.

EventLoop: fix signal race in _sigchld_init

EventLoop: fix _sigchld_io_cb to return True

This fixes an infinite loop since commit
1979a6cdfcd8c6bae4565982d82d862be07ba5be.

SubProcess: use child_watch_add

This fixes performance issues introduced by commit
9c664779a16f6cbca8a5ffe7f6b0c68572819723.

EventLoop: implement child_watch_add

portage.update.fixdbentries(): Fix ResourceWarnings with Python 3.2.

SubProcess: use non-blocking waitpid

This ensures that the EventLoop will not stop due to a waitpid call
blocking forever.

EventLoop.iteration: sleep if no IO handlers

Sleep so that we don't waste cpu time by looping too quickly. This
makes EventLoop useful for code that needs to wait for timeout
callbacks regardless of whether or not any IO handlers are currently
registered.

EventLoop.timeout_add: fix inverted min interval

Comment about _setup_pipes / PyPy GC interaction.

SpawnProcess: use os.open for /dev/null input

MergeProcess: inherit stdin for use with pdb

treewalk: handle EAGAIN from listdir for PyPy 1.8

get_open_fds: handle EAGAIN for PyPy 1.8

Scheduler: PyPy WeakValueDictionary.pop KeyError

KeyError observed from WeakValueDictionary.pop() with PyPy 1.8,
despite None given as default. Note that PyPy 1.8 has the same
WeakValueDictionary code as CPython 2.7, so it may be possible for
CPython to raise KeyError here as well.

SpawnProcess: for stdout use os.write, not fdopen

repoman: fix ebuild.badheader for bug #403705

SubProcess._wait: add debug code for bug #403697

Assert that fork returns int for bug 403697.

These cases should have been included with commit
6a94a074aa0475173a51f3f726377d4c407e986b.

AsynchronousTask: skip cancelled check in _start

These checks should be irrelevant, since the cancel() method is never
called on anything that hasn't been started already.

EventLoop: allow IO event handler re-entrance

IO event handlers may be re-entrant, in case something like
AbstractPollTask._wait_loop(), needs to be called inside a handler for
some reason.

After python fork, don't close fds for PyPy 1.8.

If we close all open file descriptors after a fork, with PyPy 1.8 it
triggers "[Errno 9] Bad file descriptor" later in the subprocess.
Apparently it is holding references to file descriptors and closing
them after they've already been closed and re-opened for other
purposes. As a workaround, we don't close the file descriptors, so
that they won't be re-used and therefore we won't be vulnerable to this
kind of interference.

The obvious caveat of not closing the fds is that the subprocess can
hold locks that belonged to the parent process, even after the parent
process has released the locks. Hopefully this won't be a major problem
though, since the subprocess has to exit at release the lock
eventually, when the EbuildFetcher or _MergeProcess task is complete.

EventLoop._do_poll: tweak EINTR handling

Silently handle EINTR, which is normal when we have received a signal
such as SIGINT. Also, raise StopIteration in order to break out of our
current iteration and respond appropriately to the signal as soon as
possible.

AsynchronousTask: don't wait for exit status

Synchronous waiting for status is not supported, since it would be
vulnerable to hitting the recursion limit when a large number of tasks
need to be terminated simultaneously, like in bug #402335.

EventLoop: make _poll/_run_timeouts re-entrant

This fixes infinite loops triggered by Ctrl-C, where timeout calls
would exhaust the poll event queue because _poll was not re-entrant.
Now, re-entrance is only prohibited for individual callback functions,
in order to protect against infinite recursion.

runtests.sh: test PyPy 1.8, and support prefix

Handle missing os.setgroups for PyPy.

See https://bugs.pypy.org/issue833 for details.

checksum.py: remove PyPy 1.7 workarounds

The corresponding hashlib issues are fixed in PyPy 1.8:

https://bugs.pypy.org/issue957

PollScheduler: use idle_add to check termination

This fixes a regression in termination signal handling since commit
8c1fcf5a9ba9fa4d406a4d0cc284fe73a84f5a63, which cause termination
signals to be ignored until a running job had exited. This regression
is not really noticeable for Ctrl-C handling, since in that case the
SIGINT propagets to subprocesses, causing them to exit and trigger a
_schedule() call whichtriggers a termination check.

repoman: check for env-update, bug #402339