[PATCH 1/5] lib: Add per-message last modification tracking
authorDavid Bremner <david@tethera.net>
Fri, 14 Aug 2015 16:47:54 +0000 (18:47 +0200)
committerW. Trevor King <wking@tremily.us>
Sat, 20 Aug 2016 21:49:20 +0000 (14:49 -0700)
f0/098a1c416f419679860c7b07434e51954800e9 [new file with mode: 0644]

diff --git a/f0/098a1c416f419679860c7b07434e51954800e9 b/f0/098a1c416f419679860c7b07434e51954800e9
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a8d8410
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,334 @@
+Return-Path: <bremner@tesseract.cs.unb.ca>\r
+X-Original-To: notmuch@notmuchmail.org\r
+Delivered-To: notmuch@notmuchmail.org\r
+Received: from localhost (localhost [127.0.0.1])\r
+ by arlo.cworth.org (Postfix) with ESMTP id 854826DE192C\r
+ for <notmuch@notmuchmail.org>; Fri, 14 Aug 2015 09:50:27 -0700 (PDT)\r
+X-Virus-Scanned: Debian amavisd-new at cworth.org\r
+X-Spam-Flag: NO\r
+X-Spam-Score: 0.132\r
+X-Spam-Level: \r
+X-Spam-Status: No, score=0.132 tagged_above=-999 required=5 tests=[AWL=0.122, \r
+ T_HEADER_FROM_DIFFERENT_DOMAINS=0.01] autolearn=disabled\r
+Received: from arlo.cworth.org ([127.0.0.1])\r
+ by localhost (arlo.cworth.org [127.0.0.1]) (amavisd-new, port 10024)\r
+ with ESMTP id 02SCi6IQTfUQ for <notmuch@notmuchmail.org>;\r
+ Fri, 14 Aug 2015 09:50:21 -0700 (PDT)\r
+Received: from gitolite.debian.net (gitolite.debian.net [87.98.215.224])\r
+ by arlo.cworth.org (Postfix) with ESMTPS id 8FA896DE1A24\r
+ for <notmuch@notmuchmail.org>; Fri, 14 Aug 2015 09:50:20 -0700 (PDT)\r
+Received: from remotemail by gitolite.debian.net with local (Exim 4.80)\r
+ (envelope-from <bremner@tesseract.cs.unb.ca>)\r
+ id 1ZQI9m-0003e4-T7; Fri, 14 Aug 2015 16:48:38 +0000\r
+Received: (nullmailer pid 15752 invoked by uid 1000); Fri, 14 Aug 2015\r
+ 16:48:02 -0000\r
+From: David Bremner <david@tethera.net>\r
+To: notmuch@notmuchmail.org\r
+Subject: [PATCH 1/5] lib: Add per-message last modification tracking\r
+Date: Fri, 14 Aug 2015 18:47:54 +0200\r
+Message-Id: <1439570878-15165-2-git-send-email-david@tethera.net>\r
+X-Mailer: git-send-email 2.5.0\r
+In-Reply-To: <1439570878-15165-1-git-send-email-david@tethera.net>\r
+References: <1439570878-15165-1-git-send-email-david@tethera.net>\r
+X-BeenThere: notmuch@notmuchmail.org\r
+X-Mailman-Version: 2.1.18\r
+Precedence: list\r
+List-Id: "Use and development of the notmuch mail system."\r
+ <notmuch.notmuchmail.org>\r
+List-Unsubscribe: <http://notmuchmail.org/mailman/options/notmuch>,\r
+ <mailto:notmuch-request@notmuchmail.org?subject=unsubscribe>\r
+List-Archive: <http://notmuchmail.org/pipermail/notmuch/>\r
+List-Post: <mailto:notmuch@notmuchmail.org>\r
+List-Help: <mailto:notmuch-request@notmuchmail.org?subject=help>\r
+List-Subscribe: <http://notmuchmail.org/mailman/listinfo/notmuch>,\r
+ <mailto:notmuch-request@notmuchmail.org?subject=subscribe>\r
+X-List-Received-Date: Fri, 14 Aug 2015 16:50:27 -0000\r
+\r
+From: Austin Clements <amdragon@mit.edu>\r
+\r
+This adds a new document value that stores the revision of the last\r
+modification to message metadata, where the revision number increases\r
+monotonically with each database commit.\r
+\r
+An alternative would be to store the wall-clock time of the last\r
+modification of each message.  In principle this is simpler and has\r
+the advantage that any process can determine the current timestamp\r
+without support from libnotmuch.  However, even assuming a computer's\r
+clock never goes backward and ignoring clock skew in networked\r
+environments, this has a fatal flaw.  Xapian uses (optimistic)\r
+snapshot isolation, which means reads can be concurrent with writes.\r
+Given this, consider the following time line with a write and two read\r
+transactions:\r
+\r
+   write  |-X-A--------------|\r
+   read 1       |---B---|\r
+   read 2                      |---|\r
+\r
+The write transaction modifies message X and records the wall-clock\r
+time of the modification at A.  The writer hangs around for a while\r
+and later commits its change.  Read 1 is concurrent with the write, so\r
+it doesn't see the change to X.  It does some query and records the\r
+wall-clock time of its results at B.  Transaction read 2 later starts\r
+after the write commits and queries for changes since wall-clock time\r
+B (say the reads are performing an incremental backup).  Even though\r
+read 1 could not see the change to X, read 2 is told (correctly) that\r
+X has not changed since B, the time of the last read.  In fact, X\r
+changed before wall-clock time A, but the change was not visible until\r
+*after* wall-clock time B, so read 2 misses the change to X.\r
+\r
+This is tricky to solve in full-blown snapshot isolation, but because\r
+Xapian serializes writes, we can use a simple, monotonically\r
+increasing database revision number.  Furthermore, maintaining this\r
+revision number requires no more IO than a wall-clock time solution\r
+because Xapian already maintains statistics on the upper (and lower)\r
+bound of each value stream.\r
+---\r
+ lib/database-private.h | 16 +++++++++++++++-\r
+ lib/database.cc        | 50 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++--\r
+ lib/message.cc         | 22 ++++++++++++++++++++++\r
+ lib/notmuch-private.h  | 10 +++++++++-\r
+ 4 files changed, 94 insertions(+), 4 deletions(-)\r
+\r
+diff --git a/lib/database-private.h b/lib/database-private.h\r
+index 24243db..5c5a2bb 100644\r
+--- a/lib/database-private.h\r
++++ b/lib/database-private.h\r
+@@ -100,6 +100,12 @@ enum _notmuch_features {\r
+      *\r
+      * Introduced: version 3. */\r
+     NOTMUCH_FEATURE_INDEXED_MIMETYPES = 1 << 5,\r
++\r
++    /* If set, messages store the revision number of the last\r
++     * modification in NOTMUCH_VALUE_LAST_MOD.\r
++     *\r
++     * Introduced: version 3. */\r
++    NOTMUCH_FEATURE_LAST_MOD = 1 << 6,\r
+ };\r
\r
+ /* In C++, a named enum is its own type, so define bitwise operators\r
+@@ -145,6 +151,8 @@ struct _notmuch_database {\r
\r
+     notmuch_database_mode_t mode;\r
+     int atomic_nesting;\r
++    /* TRUE if changes have been made in this atomic section */\r
++    notmuch_bool_t atomic_dirty;\r
+     Xapian::Database *xapian_db;\r
\r
+     /* Bit mask of features used by this database.  This is a\r
+@@ -158,6 +166,11 @@ struct _notmuch_database {\r
+      * next library call. May be NULL */\r
+     char *status_string;\r
\r
++    /* Highest committed revision number.  Modifications are recorded\r
++     * under a higher revision number, which can be generated with\r
++     * notmuch_database_new_revision. */\r
++    unsigned long revision;\r
++\r
+     Xapian::QueryParser *query_parser;\r
+     Xapian::TermGenerator *term_gen;\r
+     Xapian::ValueRangeProcessor *value_range_processor;\r
+@@ -179,7 +192,8 @@ struct _notmuch_database {\r
+  * will have it). */\r
+ #define NOTMUCH_FEATURES_CURRENT \\r
+     (NOTMUCH_FEATURE_FILE_TERMS | NOTMUCH_FEATURE_DIRECTORY_DOCS | \\r
+-     NOTMUCH_FEATURE_BOOL_FOLDER | NOTMUCH_FEATURE_GHOSTS)\r
++     NOTMUCH_FEATURE_BOOL_FOLDER | NOTMUCH_FEATURE_GHOSTS | \\r
++     NOTMUCH_FEATURE_LAST_MOD)\r
\r
+ /* Return the list of terms from the given iterator matching a prefix.\r
+  * The prefix will be stripped from the strings in the returned list.\r
+diff --git a/lib/database.cc b/lib/database.cc\r
+index 6a15174..52e2e8f 100644\r
+--- a/lib/database.cc\r
++++ b/lib/database.cc\r
+@@ -101,6 +101,9 @@ typedef struct {\r
+  *\r
+  *    SUBJECT:        The value of the "Subject" header\r
+  *\r
++ *    LAST_MOD:       The revision number as of the last tag or\r
++ *                    filename change.\r
++ *\r
+  * In addition, terms from the content of the message are added with\r
+  * "from", "to", "attachment", and "subject" prefixes for use by the\r
+  * user in searching. Similarly, terms from the path of the mail\r
+@@ -310,6 +313,8 @@ static const struct {\r
+      * them. */\r
+     { NOTMUCH_FEATURE_INDEXED_MIMETYPES,\r
+       "indexed MIME types", "w"},\r
++    { NOTMUCH_FEATURE_LAST_MOD,\r
++      "modification tracking", "w"},\r
+ };\r
\r
+ const char *\r
+@@ -737,6 +742,23 @@ _notmuch_database_ensure_writable (notmuch_database_t *notmuch)\r
+     return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;\r
+ }\r
\r
++/* Allocate a revision number for the next change. */\r
++unsigned long\r
++_notmuch_database_new_revision (notmuch_database_t *notmuch)\r
++{\r
++    unsigned long new_revision = notmuch->revision + 1;\r
++\r
++    /* If we're in an atomic section, hold off on updating the\r
++     * committed revision number until we commit the atomic section.\r
++     */\r
++    if (notmuch->atomic_nesting)\r
++      notmuch->atomic_dirty = TRUE;\r
++    else\r
++      notmuch->revision = new_revision;\r
++\r
++    return new_revision;\r
++}\r
++\r
+ /* Parse a database features string from the given database version.\r
+  * Returns the feature bit set.\r
+  *\r
+@@ -904,6 +926,7 @@ notmuch_database_open_verbose (const char *path,\r
+     notmuch->atomic_nesting = 0;\r
+     try {\r
+       string last_thread_id;\r
++      string last_mod;\r
\r
+       if (mode == NOTMUCH_DATABASE_MODE_READ_WRITE) {\r
+           notmuch->xapian_db = new Xapian::WritableDatabase (xapian_path,\r
+@@ -962,6 +985,14 @@ notmuch_database_open_verbose (const char *path,\r
+               INTERNAL_ERROR ("Malformed database last_thread_id: %s", str);\r
+       }\r
\r
++      /* Get current highest revision number. */\r
++      last_mod = notmuch->xapian_db->get_value_upper_bound (\r
++          NOTMUCH_VALUE_LAST_MOD);\r
++      if (last_mod.empty ())\r
++          notmuch->revision = 0;\r
++      else\r
++          notmuch->revision = Xapian::sortable_unserialise (last_mod);\r
++\r
+       notmuch->query_parser = new Xapian::QueryParser;\r
+       notmuch->term_gen = new Xapian::TermGenerator;\r
+       notmuch->term_gen->set_stemmer (Xapian::Stem ("english"));\r
+@@ -1369,7 +1400,8 @@ notmuch_database_upgrade (notmuch_database_t *notmuch,\r
\r
+     /* Figure out how much total work we need to do. */\r
+     if (new_features &\r
+-      (NOTMUCH_FEATURE_FILE_TERMS | NOTMUCH_FEATURE_BOOL_FOLDER)) {\r
++      (NOTMUCH_FEATURE_FILE_TERMS | NOTMUCH_FEATURE_BOOL_FOLDER |\r
++       NOTMUCH_FEATURE_LAST_MOD)) {\r
+       notmuch_query_t *query = notmuch_query_create (notmuch, "");\r
+       total += notmuch_query_count_messages (query);\r
+       notmuch_query_destroy (query);\r
+@@ -1396,7 +1428,8 @@ notmuch_database_upgrade (notmuch_database_t *notmuch,\r
\r
+     /* Perform per-message upgrades. */\r
+     if (new_features &\r
+-      (NOTMUCH_FEATURE_FILE_TERMS | NOTMUCH_FEATURE_BOOL_FOLDER)) {\r
++      (NOTMUCH_FEATURE_FILE_TERMS | NOTMUCH_FEATURE_BOOL_FOLDER |\r
++       NOTMUCH_FEATURE_LAST_MOD)) {\r
+       notmuch_query_t *query = notmuch_query_create (notmuch, "");\r
+       notmuch_messages_t *messages;\r
+       notmuch_message_t *message;\r
+@@ -1433,6 +1466,14 @@ notmuch_database_upgrade (notmuch_database_t *notmuch,\r
+           if (new_features & NOTMUCH_FEATURE_BOOL_FOLDER)\r
+               _notmuch_message_upgrade_folder (message);\r
\r
++          /* Prior to NOTMUCH_FEATURE_LAST_MOD, messages did not\r
++           * track modification revisions.  Give all messages the\r
++           * next available revision; since we just started tracking\r
++           * revisions for this database, that will be 1.\r
++           */\r
++          if (new_features & NOTMUCH_FEATURE_LAST_MOD)\r
++              _notmuch_message_upgrade_last_mod (message);\r
++\r
+           _notmuch_message_sync (message);\r
\r
+           notmuch_message_destroy (message);\r
+@@ -1615,6 +1656,11 @@ notmuch_database_end_atomic (notmuch_database_t *notmuch)\r
+       return NOTMUCH_STATUS_XAPIAN_EXCEPTION;\r
+     }\r
\r
++    if (notmuch->atomic_dirty) {\r
++      ++notmuch->revision;\r
++      notmuch->atomic_dirty = FALSE;\r
++    }\r
++\r
+ DONE:\r
+     notmuch->atomic_nesting--;\r
+     return NOTMUCH_STATUS_SUCCESS;\r
+diff --git a/lib/message.cc b/lib/message.cc\r
+index 1ddce3c..26b5e76 100644\r
+--- a/lib/message.cc\r
++++ b/lib/message.cc\r
+@@ -998,6 +998,16 @@ _notmuch_message_set_header_values (notmuch_message_t *message,\r
+     message->modified = TRUE;\r
+ }\r
\r
++/* Upgrade a message to support NOTMUCH_FEATURE_LAST_MOD.  The caller\r
++ * must call _notmuch_message_sync. */\r
++void\r
++_notmuch_message_upgrade_last_mod (notmuch_message_t *message)\r
++{\r
++    /* _notmuch_message_sync will update the last modification\r
++     * revision; we just have to ask it to. */\r
++    message->modified = TRUE;\r
++}\r
++\r
+ /* Synchronize changes made to message->doc out into the database. */\r
+ void\r
+ _notmuch_message_sync (notmuch_message_t *message)\r
+@@ -1010,6 +1020,18 @@ _notmuch_message_sync (notmuch_message_t *message)\r
+     if (! message->modified)\r
+       return;\r
\r
++    /* Update the last modification of this message. */\r
++    if (message->notmuch->features & NOTMUCH_FEATURE_LAST_MOD)\r
++      /* sortable_serialise gives a reasonably compact encoding,\r
++       * which directly translates to reduced IO when scanning the\r
++       * value stream.  Since it's built for doubles, we only get 53\r
++       * effective bits, but that's still enough for the database to\r
++       * last a few centuries at 1 million revisions per second. */\r
++      message->doc.add_value (NOTMUCH_VALUE_LAST_MOD,\r
++                              Xapian::sortable_serialise (\r
++                                  _notmuch_database_new_revision (\r
++                                      message->notmuch)));\r
++\r
+     db = static_cast <Xapian::WritableDatabase *> (message->notmuch->xapian_db);\r
+     db->replace_document (message->doc_id, message->doc);\r
+     message->modified = FALSE;\r
+diff --git a/lib/notmuch-private.h b/lib/notmuch-private.h\r
+index cc9ce12..f52b4e4 100644\r
+--- a/lib/notmuch-private.h\r
++++ b/lib/notmuch-private.h\r
+@@ -107,7 +107,8 @@ typedef enum {\r
+     NOTMUCH_VALUE_TIMESTAMP = 0,\r
+     NOTMUCH_VALUE_MESSAGE_ID,\r
+     NOTMUCH_VALUE_FROM,\r
+-    NOTMUCH_VALUE_SUBJECT\r
++    NOTMUCH_VALUE_SUBJECT,\r
++    NOTMUCH_VALUE_LAST_MOD,\r
+ } notmuch_value_t;\r
\r
+ /* Xapian (with flint backend) complains if we provide a term longer\r
+@@ -194,6 +195,9 @@ void\r
+ _notmuch_database_log (notmuch_database_t *notmuch,\r
+                      const char *format, ...);\r
\r
++unsigned long\r
++_notmuch_database_new_revision (notmuch_database_t *notmuch);\r
++\r
+ const char *\r
+ _notmuch_database_relative_path (notmuch_database_t *notmuch,\r
+                                const char *path);\r
+@@ -305,6 +309,10 @@ _notmuch_message_set_header_values (notmuch_message_t *message,\r
+                                   const char *date,\r
+                                   const char *from,\r
+                                   const char *subject);\r
++\r
++void\r
++_notmuch_message_upgrade_last_mod (notmuch_message_t *message);\r
++\r
+ void\r
+ _notmuch_message_sync (notmuch_message_t *message);\r
\r
+-- \r
+2.5.0\r
+\r