sci-chemistry/suitename/metadata.xml

   1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
   2 <!DOCTYPE pkgmetadata SYSTEM "https://www.gentoo.org/dtd/metadata.dtd">
   3 <pkgmetadata>
   4         <herd>sci-chemistry</herd>
   5         <maintainer>
   6                 <email>jlec@gentoo.org</email>
   7         </maintainer>
   8         <longdescription>
   9 Suitename is a new C program that supports the ROC RNA Ontology Consortium
  10 consensus RNA backbone nomenclature and conformer-list development (see our RNA
  11 backbone rotamer section.
  12 From dihedral-angle input for a specific RNA structure (usually from Dangle),
  13 Suitename categorizes the RNA backbone geometry of each suite (the
  14 sugar-to-sugar version of a residue) either as an outlier ("!!") or as belonging
  15 to one of the 53 defined conformer bins. The output is either a
  16 one-line-per-suite report, or a linear conformer string (as shown below the
  17 image here) in one of several variant formats. Suitename is built into
  18 MolProbity, producing entries in the multi-criterion chart for an RNA model and
  19 also a suitestring file. The Suitename code is made available here for bulk or
  20 individual command-line use.
  21 </longdescription>
  22 </pkgmetadata>