sci-biology/sibsim4/sibsim4-0.20.ebuild

   1 # Copyright 1999-2013 Gentoo Foundation
   2 # Distributed under the terms of the GNU General Public License v2
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   4 EAPI=5
   5
   6 inherit toolchain-funcs
   7
   8 DESCRIPTION="A rewrite and improvement upon sim4, a DNA-mRNA aligner"
   9 HOMEPAGE="http://sibsim4.sourceforge.net/"
  10 SRC_URI="mirror://sourceforge/${PN}/SIBsim4-${PV}.tar.gz"
  11
  12 LICENSE="GPL-2"
  13 SLOT="0"
  14 IUSE=""
  15 KEYWORDS="amd64 x86"
  16
  17 DEPEND=""
  18 RDEPEND=""
  19
  20 S="${WORKDIR}/SIBsim4-${PV}"
  21
  22 src_prepare() {
  23         sed \
  24                 -e 's/CFLAGS = /CFLAGS +=/' \
  25                 -e '/^CC/s:=:?=:' \
  26                 -e '/^OPT/d' \
  27                 -e "s:-o:${LDFLAGS} -o:g" \
  28                 -i "${S}/Makefile" || die
  29         tc-export CC
  30 }
  31
  32 src_install() {
  33         dobin SIBsim4
  34         doman SIBsim4.1
  35 }