eclass/emboss-r2.eclass

   1 # Copyright 1999-2017 Gentoo Foundation
   2 # Distributed under the terms of the GNU General Public License v2
   3
   4 # @ECLASS: emboss-r2.eclass
   5 # @MAINTAINER:
   6 # sci-biology@gentoo.org
   7 # jlec@gentoo.org
   8 # ted.tanberry@gmail.com
   9 # @AUTHOR:
  10 # Original author: Author Olivier Fisette <ofisette@gmail.com>
  11 # Next gen author: Justin Lecher <jlec@gentoo.org>
  12 # Next gen author: Ted Tanberry <ted.tanberry@gmail.com>
  13 # @BLURB: Use this to easy install EMBOSS and EMBASSY programs (EMBOSS add-ons).
  14 # @DESCRIPTION:
  15 # The inheriting ebuild must set at least EAPI=6 and provide EBO_DESCRIPTION before the inherit line.
  16 # KEYWORDS should be set. Additionally "(R|P)DEPEND"encies and other standard
  17 # ebuild variables can be extended (FOO+=" bar").
  18 #
  19 # Example:
  20 #
  21 # EAPI=6
  22 #
  23 # EBO_DESCRIPTION="applications from the CBS group"
  24 #
  25 # inherit emboss-r2
  26
  27 # @ECLASS-VARIABLE: EBO_DESCRIPTION
  28 # @DEFAULT_UNSET
  29 # @DESCRIPTION:
  30 # Should be set. Completes the generic description of the embassy module as follows:
  31 #
  32 # EMBOSS integrated version of ${EBO_DESCRIPTION}, e.g.
  33 #
  34 # "EMBOSS integrated version of applications from the CBS group"
  35 #
  36 # Defaults to the upstream name of the module.
  37
  38 if [[ ! ${_EMBOSS_R2} ]]; then
  39
  40 case ${EAPI:-0} in
  41         6) ;;
  42         *) die "EAPI=${EAPI} is not supported" ;;
  43 esac
  44
  45 inherit autotools flag-o-matic
  46
  47 EXPORT_FUNCTIONS src_prepare src_configure src_install
  48
  49 HOMEPAGE="http://emboss.sourceforge.net/"
  50 LICENSE="LGPL-2 GPL-2"
  51
  52 SLOT="0"
  53 IUSE="mysql pdf png postgres static-libs X"
  54
  55 RDEPEND="
  56         dev-libs/expat
  57         dev-libs/libpcre:3
  58         sci-libs/plplot:=
  59         sys-libs/zlib
  60         mysql? ( virtual/mysql )
  61         pdf? ( media-libs/libharu:= )
  62         png? ( media-libs/gd:2=[png] )
  63         postgres? ( dev-db/postgresql:= )
  64         X? ( x11-libs/libXt )"
  65
  66 if [[ ${PN} == embassy-* ]]; then
  67         EMBASSY_PACKAGE=yes
  68         # The EMBASSY package name, retrieved from the inheriting ebuild's name
  69         EN=${PN:8}
  70         # The full name and version of the EMBASSY package (excluding the Gentoo
  71         # revision number)
  72         EF="${EN^^}-${PV}"
  73
  74         [[ ${EBO_DESCRIPTION} ]] || die "EBO_DESCRIPTION was not set before inheriting emboss-r2.eclass"
  75
  76         DESCRIPTION="EMBOSS integrated version of ${EBO_DESCRIPTION}"
  77         SRC_URI="ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS/${EF}.tar.gz -> embassy-${EN}-${PV}.tar.gz"
  78         RDEPEND+=" >=sci-biology/emboss-6.6.0-r1[mysql=,pdf=,png=,postgres=,static-libs=,X=]"
  79
  80         S="${WORKDIR}/${EF}"
  81 fi
  82
  83 DEPEND="${RDEPEND}"
  84
  85 # @ECLASS-VARIABLE: EBO_EAUTORECONF
  86 # @DEFAULT_UNSET
  87 # @DESCRIPTION:
  88 # If set, run eautoreconf from autotools.eclass after applying patches
  89 # in emboss-r2_src_prepare.
  90
  91 # @FUNCTION: emboss-r2_src_prepare
  92 # @DESCRIPTION:
  93 # Does the following things
  94 #
  95 #  1. Renames configure.in to configure.ac, if possible
  96 #  2. Calls default_src_prepare (i.e.
  97 #     applies Gentoo and user patches in EAPI>=6)
  98 #  3. If EBO_EAUTORECONF is set, run eautoreconf
  99 #
 100
 101 emboss-r2_src_prepare() {
 102         if [[ -e configure.in ]]; then
 103                 mv configure.{in,ac} || die
 104         fi
 105
 106         default
 107         [[ ${EBO_EAUTORECONF} ]] && eautoreconf
 108 }
 109
 110 # @FUNCTION: emboss-r2_src_configure
 111 # @DESCRIPTION:
 112 # runs econf with following options.
 113 #
 114 #  --enable-shared
 115 #  $(use_enable static-libs static)
 116 #  $(use_with X x)
 117 #  $(use_with png pngdriver)
 118 #  $(use_with pdf hpdf)
 119 #  $(use_with mysql mysql)
 120 #  $(use_with postgres postgresql)
 121 #  --enable-large
 122 #  --without-java
 123 #  --enable-systemlibs
 124 #
 125 #  can be appended to like econf, e.g.
 126 #    emboss-r2_src_configure --disable-shared
 127
 128 emboss-r2_src_configure() {
 129         local myconf=(
 130                 --enable-shared
 131                 $(use_enable static-libs static)
 132                 $(use_with X x)
 133                 $(use_with png pngdriver "${EPREFIX}/usr")
 134                 $(use_with pdf hpdf "${EPREFIX}/usr")
 135                 $(use_with mysql mysql "${EPREFIX}/usr/bin/mysql_config")
 136                 $(use_with postgres postgresql "${EPREFIX}/usr/bin/pg_config")
 137                 --enable-large
 138                 --without-java
 139                 --enable-systemlibs
 140         )
 141
 142         [[ ${EMBASSY_PACKAGE} == yes ]] && \
 143                 append-cppflags "-I${EPREFIX}/usr/include/emboss"
 144
 145         econf "${myconf[@]}" "$@"
 146 }
 147
 148 # @FUNCTION: emboss-r2_src_install
 149 # @DESCRIPTION:
 150 # Installs the package into the staging area and removes
 151 # extraneous .la files, if USE="-static-libs"
 152
 153 emboss-r2_src_install() {
 154         default
 155
 156         # delete .la files
 157         if ! use static-libs; then
 158                 find "${D}" -name '*.la' -delete || die
 159         fi
 160 }
 161
 162 _EMBOSS_R2=1
 163 fi